中国科学C辑
中國科學C輯
중국과학C집
SCIENCE IN CHINA (SERIES C)
2006年
1期
1-8
,共8页
赵辉%李启寨%李俊%曾长青%胡松年%于军
趙輝%李啟寨%李俊%曾長青%鬍鬆年%于軍
조휘%리계채%리준%증장청%호송년%우군
点突变%单碱基多态性%替换%替换偏差%转换%颠换
點突變%單堿基多態性%替換%替換偏差%轉換%顛換
점돌변%단감기다태성%체환%체환편차%전환%전환
碱基替换突变是形成物种多态性和造成生物进化的根本原因之一.近年的研究表明:基因组的碱基组分在不同程度上与碱基替换突变的发生相关.以水稻全基因组3611007个SNPs(包括45462个编码区SNPs和242811个内含子区SNPs)和拟南芥全基因组32019个SNPs为研究对象,研究突变位点周围的碱基A&T(A和T)的使用频率和点突变类型的相关性,结果表明:水稻和拟南芥全基因组上转换和颠换的比值(Ts/Tv)以及紧邻突变位点(上下游各1个碱基)上A&T碱基的个数负相关.统计了6种SNP的AT2(直接相邻的碱基是A或T的个数)和AT0(直接相邻碱基是C或G的个数),发现水稻和拟南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,说明C/G型SNP可能受直接临近区域上A&T碱基的影响最大.在水稻全基因组SNPs中,A&T碱基影响突变的范围局限在突变位点上下游2个碱基内.拟南芥A&T碱基影响其全基因组SNPs的范围不超过上下游4个碱基.
堿基替換突變是形成物種多態性和造成生物進化的根本原因之一.近年的研究錶明:基因組的堿基組分在不同程度上與堿基替換突變的髮生相關.以水稻全基因組3611007箇SNPs(包括45462箇編碼區SNPs和242811箇內含子區SNPs)和擬南芥全基因組32019箇SNPs為研究對象,研究突變位點週圍的堿基A&T(A和T)的使用頻率和點突變類型的相關性,結果錶明:水稻和擬南芥全基因組上轉換和顛換的比值(Ts/Tv)以及緊鄰突變位點(上下遊各1箇堿基)上A&T堿基的箇數負相關.統計瞭6種SNP的AT2(直接相鄰的堿基是A或T的箇數)和AT0(直接相鄰堿基是C或G的箇數),髮現水稻和擬南芥都是C/G型SNP的AT2/AT0值最大,說明C/G型SNP可能受直接臨近區域上A&T堿基的影響最大.在水稻全基因組SNPs中,A&T堿基影響突變的範圍跼限在突變位點上下遊2箇堿基內.擬南芥A&T堿基影響其全基因組SNPs的範圍不超過上下遊4箇堿基.
감기체환돌변시형성물충다태성화조성생물진화적근본원인지일.근년적연구표명:기인조적감기조분재불동정도상여감기체환돌변적발생상관.이수도전기인조3611007개SNPs(포괄45462개편마구SNPs화242811개내함자구SNPs)화의남개전기인조32019개SNPs위연구대상,연구돌변위점주위적감기A&T(A화T)적사용빈솔화점돌변류형적상관성,결과표명:수도화의남개전기인조상전환화전환적비치(Ts/Tv)이급긴린돌변위점(상하유각1개감기)상A&T감기적개수부상관.통계료6충SNP적AT2(직접상린적감기시A혹T적개수)화AT0(직접상린감기시C혹G적개수),발현수도화의남개도시C/G형SNP적AT2/AT0치최대,설명C/G형SNP가능수직접림근구역상A&T감기적영향최대.재수도전기인조SNPs중,A&T감기영향돌변적범위국한재돌변위점상하유2개감기내.의남개A&T감기영향기전기인조SNPs적범위불초과상하유4개감기.
