生物技术通讯
生物技術通訊
생물기술통신
LETTERS IN BIOTECHNOLOGY
2007年
3期
434-436
,共3页
宋博强%霍艳英%胡迎春%李刚%吴德昌
宋博彊%霍豔英%鬍迎春%李剛%吳德昌
송박강%곽염영%호영춘%리강%오덕창
多效生长因子%cDNA微阵列%生物信息学分析
多效生長因子%cDNA微陣列%生物信息學分析
다효생장인자%cDNA미진렬%생물신식학분석
目的:用生物信息学方法分析多效生长因子(PTN)潜在的分子功能.方法:利用由美国亚利桑那癌中心提供的生物信息学数据库,对前期用小鼠全基因组表达谱芯片检测到的Rtn相关基因进行生物信息学分析,通过GO Terms分析这些基因所属的功能群体,用Pathway Miner分析这些基因参与调控的信号通路.结果:370个由芯片检测得到的Rtn相关基因中,在GO Terms数据库中找到231个基因,其中参与细胞成分构成的基因占31.83%,具有分子功能的基因占35.34%,而参与生物学过程的基因占32.83%;在Pathway Miner数据库中找到105个基因.这些基因相关的信号通路有230条,分别属于细胞和调控过程通路以及代谢通路.结论:PTN是一个重要的细胞因子,可能参与机体的免疫与防御反应、炎症反应,以及细胞的增殖、凋亡调控等.
目的:用生物信息學方法分析多效生長因子(PTN)潛在的分子功能.方法:利用由美國亞利桑那癌中心提供的生物信息學數據庫,對前期用小鼠全基因組錶達譜芯片檢測到的Rtn相關基因進行生物信息學分析,通過GO Terms分析這些基因所屬的功能群體,用Pathway Miner分析這些基因參與調控的信號通路.結果:370箇由芯片檢測得到的Rtn相關基因中,在GO Terms數據庫中找到231箇基因,其中參與細胞成分構成的基因佔31.83%,具有分子功能的基因佔35.34%,而參與生物學過程的基因佔32.83%;在Pathway Miner數據庫中找到105箇基因.這些基因相關的信號通路有230條,分彆屬于細胞和調控過程通路以及代謝通路.結論:PTN是一箇重要的細胞因子,可能參與機體的免疫與防禦反應、炎癥反應,以及細胞的增殖、凋亡調控等.
목적:용생물신식학방법분석다효생장인자(PTN)잠재적분자공능.방법:이용유미국아리상나암중심제공적생물신식학수거고,대전기용소서전기인조표체보심편검측도적Rtn상관기인진행생물신식학분석,통과GO Terms분석저사기인소속적공능군체,용Pathway Miner분석저사기인삼여조공적신호통로.결과:370개유심편검측득도적Rtn상관기인중,재GO Terms수거고중조도231개기인,기중삼여세포성분구성적기인점31.83%,구유분자공능적기인점35.34%,이삼여생물학과정적기인점32.83%;재Pathway Miner수거고중조도105개기인.저사기인상관적신호통로유230조,분별속우세포화조공과정통로이급대사통로.결론:PTN시일개중요적세포인자,가능삼여궤체적면역여방어반응、염증반응,이급세포적증식、조망조공등.
