化学学报
化學學報
화학학보
ACTA CHIMICA SINICA
2007年
16期
1693-1701
,共9页
陈沛全%刘幸海%孙宏伟%王宝雷%李正名%赖城明
陳沛全%劉倖海%孫宏偉%王寶雷%李正名%賴城明
진패전%류행해%손굉위%왕보뢰%리정명%뢰성명
酮醇酸还原异构酶(KARI)%抑制剂%Possion-Boltzmann方程%分子对接%密度泛函理论
酮醇痠還原異構酶(KARI)%抑製劑%Possion-Boltzmann方程%分子對接%密度汎函理論
동순산환원이구매(KARI)%억제제%Possion-Boltzmann방정%분자대접%밀도범함이론
采用MCCE,Autodock及密度泛函方法对酮醇酸还原异构酶(KARI)与其抑制剂间相互作用进行了研究.计算结果表明,KARI活性位点中的Mg2+在活性位点残基的离子化状态、活性位点的静电性质以及与抑制剂结合等方面起重要的作用;同时,抑制剂在结合方式、前线轨道布居及静电势等方面与酶促反应中间体(HOIV)具有一定程度的相似性;可电离的羧基是当前发现的靶向KARI抑制剂一个重要的结构特征,进一步推广可认为潜在的抑制剂应该拥有可电离成负电荷的功能团.在药物设计中考虑到以上结论,将有利于发现和改造靶向KARI的抑制剂.
採用MCCE,Autodock及密度汎函方法對酮醇痠還原異構酶(KARI)與其抑製劑間相互作用進行瞭研究.計算結果錶明,KARI活性位點中的Mg2+在活性位點殘基的離子化狀態、活性位點的靜電性質以及與抑製劑結閤等方麵起重要的作用;同時,抑製劑在結閤方式、前線軌道佈居及靜電勢等方麵與酶促反應中間體(HOIV)具有一定程度的相似性;可電離的羧基是噹前髮現的靶嚮KARI抑製劑一箇重要的結構特徵,進一步推廣可認為潛在的抑製劑應該擁有可電離成負電荷的功能糰.在藥物設計中攷慮到以上結論,將有利于髮現和改造靶嚮KARI的抑製劑.
채용MCCE,Autodock급밀도범함방법대동순산환원이구매(KARI)여기억제제간상호작용진행료연구.계산결과표명,KARI활성위점중적Mg2+재활성위점잔기적리자화상태、활성위점적정전성질이급여억제제결합등방면기중요적작용;동시,억제제재결합방식、전선궤도포거급정전세등방면여매촉반응중간체(HOIV)구유일정정도적상사성;가전리적최기시당전발현적파향KARI억제제일개중요적결구특정,진일보추엄가인위잠재적억제제응해옹유가전리성부전하적공능단.재약물설계중고필도이상결론,장유리우발현화개조파향KARI적억제제.
