遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2008年
5期
595-601
,共7页
洪晓武%张亚平%储以微%高海峰%蒋正刚%熊思东
洪曉武%張亞平%儲以微%高海峰%蔣正剛%熊思東
홍효무%장아평%저이미%고해봉%장정강%웅사동
人猿超科%旧大陆猴%FKN%测序%进化分析
人猿超科%舊大陸猴%FKN%測序%進化分析
인원초과%구대륙후%FKN%측서%진화분석
测定人猿超科(人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩和长臂猿)和旧大陆猴(猕猴和叶猴)7种高等灵长类FKN全基因序列,探讨其系统进化分析.用简并引物PCR(Degenerated PCR)法分别扩增FKN的3个外显子,其产物经琼脂糖凝胶回收、纯化后测序,然后用BioEdit软件剪切拼接FKN基因全序列,用DNAStar比对后比较基因和氨基酸序列同源性,Mega软件重构FKN基因进化树,应用Datamonkey分析FKN的负选择位点.序列分析发现人猿超科较旧大陆猴FKN基因除了有散在的点突变外,还有一明显的30 bp的核苷酸缺失突变;人FKN基因序列与黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴的同源性分别是99.2%、98.4%、98.1%、96.5%%、95.95和93.8%,由此推导的氨基酸序列同源性分别是98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%和90.5%;FKN基因进化树表明人与黑猩猩关系更近,FKN基因进化和通常认为的物种进化一致;Datamonkey分析结果显示FKN存在3个负选择位点53Q.84D、239N.成功获得人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴7种高等灵长类物种FKN全基因序列,为后续探讨FKN在高等灵长类物种进化过程中免疫学功能演变及其结构与功能的关系奠定基础.
測定人猿超科(人、黑猩猩、大猩猩、紅毛猩猩和長臂猿)和舊大陸猴(獼猴和葉猴)7種高等靈長類FKN全基因序列,探討其繫統進化分析.用簡併引物PCR(Degenerated PCR)法分彆擴增FKN的3箇外顯子,其產物經瓊脂糖凝膠迴收、純化後測序,然後用BioEdit軟件剪切拼接FKN基因全序列,用DNAStar比對後比較基因和氨基痠序列同源性,Mega軟件重構FKN基因進化樹,應用Datamonkey分析FKN的負選擇位點.序列分析髮現人猿超科較舊大陸猴FKN基因除瞭有散在的點突變外,還有一明顯的30 bp的覈苷痠缺失突變;人FKN基因序列與黑猩猩、大猩猩、紅毛猩猩、長臂猿、獼猴和葉猴的同源性分彆是99.2%、98.4%、98.1%、96.5%%、95.95和93.8%,由此推導的氨基痠序列同源性分彆是98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%和90.5%;FKN基因進化樹錶明人與黑猩猩關繫更近,FKN基因進化和通常認為的物種進化一緻;Datamonkey分析結果顯示FKN存在3箇負選擇位點53Q.84D、239N.成功穫得人、黑猩猩、大猩猩、紅毛猩猩、長臂猿、獼猴和葉猴7種高等靈長類物種FKN全基因序列,為後續探討FKN在高等靈長類物種進化過程中免疫學功能縯變及其結構與功能的關繫奠定基礎.
측정인원초과(인、흑성성、대성성、홍모성성화장비원)화구대륙후(미후화협후)7충고등령장류FKN전기인서렬,탐토기계통진화분석.용간병인물PCR(Degenerated PCR)법분별확증FKN적3개외현자,기산물경경지당응효회수、순화후측서,연후용BioEdit연건전절병접FKN기인전서렬,용DNAStar비대후비교기인화안기산서렬동원성,Mega연건중구FKN기인진화수,응용Datamonkey분석FKN적부선택위점.서렬분석발현인원초과교구대륙후FKN기인제료유산재적점돌변외,환유일명현적30 bp적핵감산결실돌변;인FKN기인서렬여흑성성、대성성、홍모성성、장비원、미후화협후적동원성분별시99.2%、98.4%、98.1%、96.5%%、95.95화93.8%,유차추도적안기산서렬동원성분별시98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%화90.5%;FKN기인진화수표명인여흑성성관계경근,FKN기인진화화통상인위적물충진화일치;Datamonkey분석결과현시FKN존재3개부선택위점53Q.84D、239N.성공획득인、흑성성、대성성、홍모성성、장비원、미후화협후7충고등령장류물충FKN전기인서렬,위후속탐토FKN재고등령장류물충진화과정중면역학공능연변급기결구여공능적관계전정기출.