军事医学科学院院刊
軍事醫學科學院院刊
군사의학과학원원간
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2004年
1期
52-56,60
,共6页
翟芸%周钢桥%董晓佳%张秀梅%贺凤英%汪海建%周凯欣%郝冰涛%朱云平%贺福初
翟蕓%週鋼橋%董曉佳%張秀梅%賀鳳英%汪海建%週凱訢%郝冰濤%硃雲平%賀福初
적예%주강교%동효가%장수매%하봉영%왕해건%주개흔%학빙도%주운평%하복초
多态性,单核苷酸%SNP分型%大规模DNA测序%PCR-RFLP%TaqMan
多態性,單覈苷痠%SNP分型%大規模DNA測序%PCR-RFLP%TaqMan
다태성,단핵감산%SNP분형%대규모DNA측서%PCR-RFLP%TaqMan
目的:建立发掘未知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和已知SNPs分型的技术平台.方法:运用PCR产物双向大规模测序的方法发掘未知SNPs;运用基于聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction endonuclease digestion, PCR-RFLP)、TaqMan技术对已知SNPs进行分型.结果:建立了基于PCR产物双向大规模测序发掘未知SNP的技术平台,并以此在27个个体的69个乙型肝炎候选易感基因区域检测到592个SNPs,核苷酸变异度为(4.51 ± 1.24)×10-4;建成基于PCR-RFLP和TaqMan的SNP分型技术平台,这两种方法与直接测序法比较,PCR-RFLP的检出率达到100%,错误率几乎为0,并且操作简单,成本低廉;TaqMan分型技术的检出率也可达到100%,与测序结果的一致性达到100%,并且过程简单、易于操作,结果直观,易于判断,也能快速得到结果.结论:基于PCR产物双向大规模测序发掘未知SNPs的技术平台成熟可靠,适于准确、大规模地发掘未知SNPs;PCR-RFLP技术和TaqMan分型技术均适用于今后大规模正常人群和疾病人群的SNPs分型,为进行关联分析以确定疾病相关的SNPs奠定了坚实的技术基础.
目的:建立髮掘未知單覈苷痠多態性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和已知SNPs分型的技術平檯.方法:運用PCR產物雙嚮大規模測序的方法髮掘未知SNPs;運用基于聚閤酶鏈反應-限製性片段長度多態性(polymerase chain reaction-restriction endonuclease digestion, PCR-RFLP)、TaqMan技術對已知SNPs進行分型.結果:建立瞭基于PCR產物雙嚮大規模測序髮掘未知SNP的技術平檯,併以此在27箇箇體的69箇乙型肝炎候選易感基因區域檢測到592箇SNPs,覈苷痠變異度為(4.51 ± 1.24)×10-4;建成基于PCR-RFLP和TaqMan的SNP分型技術平檯,這兩種方法與直接測序法比較,PCR-RFLP的檢齣率達到100%,錯誤率幾乎為0,併且操作簡單,成本低廉;TaqMan分型技術的檢齣率也可達到100%,與測序結果的一緻性達到100%,併且過程簡單、易于操作,結果直觀,易于判斷,也能快速得到結果.結論:基于PCR產物雙嚮大規模測序髮掘未知SNPs的技術平檯成熟可靠,適于準確、大規模地髮掘未知SNPs;PCR-RFLP技術和TaqMan分型技術均適用于今後大規模正常人群和疾病人群的SNPs分型,為進行關聯分析以確定疾病相關的SNPs奠定瞭堅實的技術基礎.
목적:건립발굴미지단핵감산다태성(single nucleotide polymorphisms,SNPs)화이지SNPs분형적기술평태.방법:운용PCR산물쌍향대규모측서적방법발굴미지SNPs;운용기우취합매련반응-한제성편단장도다태성(polymerase chain reaction-restriction endonuclease digestion, PCR-RFLP)、TaqMan기술대이지SNPs진행분형.결과:건립료기우PCR산물쌍향대규모측서발굴미지SNP적기술평태,병이차재27개개체적69개을형간염후선역감기인구역검측도592개SNPs,핵감산변이도위(4.51 ± 1.24)×10-4;건성기우PCR-RFLP화TaqMan적SNP분형기술평태,저량충방법여직접측서법비교,PCR-RFLP적검출솔체도100%,착오솔궤호위0,병차조작간단,성본저렴;TaqMan분형기술적검출솔야가체도100%,여측서결과적일치성체도100%,병차과정간단、역우조작,결과직관,역우판단,야능쾌속득도결과.결론:기우PCR산물쌍향대규모측서발굴미지SNPs적기술평태성숙가고,괄우준학、대규모지발굴미지SNPs;PCR-RFLP기술화TaqMan분형기술균괄용우금후대규모정상인군화질병인군적SNPs분형,위진행관련분석이학정질병상관적SNPs전정료견실적기술기출.
