CAJ | 학술논문

同源四倍体水稻突变株D4063-1直链淀粉含量比来源二倍体明恢63下降一半,即其直链淀粉含量为5.23%.为研究其直链淀粉含量下降的原因,根据普通水稻Wx基因设计引物,扩增测序获得了D4063-1Wx基因的全序列,并与已报道的Wx基因进行比对分析;同源四倍体水稻D4063-1Wx基因最显著变化为在外显子序列中发生碱基缺失,导致移码突变,在第9外显子终止密码子提前出现.D4063-1Wx基因碱基位点的变化还导致其序列上酶切位点的变化,对常用限制性内切酶位点分析结果表明,同源四倍体水稻相对于籼稻和粳稻多了2个sph I酶切位点,相对于粳稻减少了6个Acc I,增加了4个Xba I,1个Xho I,1个Pst I和1个Sal I酶切位点.聚类分析表明D4063-1Wx基因序列与籼稻亲源关系较近,由此推测D4063-1Wx基因来源于籼稻的Wxa基因型.另外,根据D4063-1wx基因的碱基差异,推测D4063-1Wx基因外显子碱基变化导致的RNA加工障碍是其直链淀粉降低的主要原因,并可能与其米饭较软等品质相关.本研究还根据D4063-1和籼稻、粳稻的序列差异及D4063-1在该片段上的特征序列位点设计了用于识别D4063-1的寡核苷酸片段,并作为PCR反应的引物命名为AUT4063-1,将该引物与作者设计的扩增普通籼稻、粳稻Wx基因的引物F5配合使用,建立了识别 D4063-1的显性和共显性两种检测方式的分子标记,为快速、准确鉴别低直链淀粉含量突变体D4063-1创造了条件.
동원사배체수도돌변주D4063-1직련정분함량비래원이배체명회63하강일반,즉기직련정분함량위5.23%.위연구기직련정분함량하강적원인,근거보통수도Wx기인설계인물,확증측서획득료D4063-1Wx기인적전서렬,병여이보도적Wx기인진행비대분석;동원사배체수도D4063-1Wx기인최현저변화위재외현자서렬중발생감기결실,도치이마돌변,재제9외현자종지밀마자제전출현.D4063-1Wx기인감기위점적변화환도치기서렬상매절위점적변화,대상용한제성내절매위점분석결과표명,동원사배체수도상대우선도화갱도다료2개sph I매절위점,상대우갱도감소료6개Acc I,증가료4개Xba I,1개Xho I,1개Pst I화1개Sal I매절위점.취류분석표명D4063-1Wx기인서렬여선도친원관계교근,유차추측D4063-1Wx기인래원우선도적Wxa기인형.령외,근거D4063-1wx기인적감기차이,추측D4063-1Wx기인외현자감기변화도치적RNA가공장애시기직련정분강저적주요원인,병가능여기미반교연등품질상관.본연구환근거D4063-1화선도、갱도적서렬차이급D4063-1재해편단상적특정서렬위점설계료용우식별D4063-1적과핵감산편단,병작위PCR반응적인물명명위AUT4063-1,장해인물여작자설계적확증보통선도、갱도Wx기인적인물F5배합사용,건립료식별 D4063-1적현성화공현성량충검측방식적분자표기,위쾌속、준학감별저직련정분함량돌변체D4063-1창조료조건.