生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2007年
6期
625-633
,共9页
谈效俊%张永新%钱敏平%张幼怡%邓明华
談效俊%張永新%錢敏平%張幼怡%鄧明華
담효준%장영신%전민평%장유이%산명화
基因芯片%标准化%相关系数
基因芯片%標準化%相關繫數
기인심편%표준화%상관계수
在基因芯片实验中,基因表达水平之间的相关性在推断基因间相互关系时起到非常重要的作用.未经标准化处理的芯片数据基因之间往往都呈现出很强的相关性,这些高相关性一部分是由基因表达水平变化引起的,而另外一部分是由系统偏差引起的.对芯片数据进行标准化处理的目的之一是消除系统偏差引起的高相关性,同时保留由真正生物学原因引起的基因表达水平高相关性.虽然目前对标准化方法已经有了不少比较研究,但还较少有人研究标准化方法对基因之间相关系数的影响,以及哪种方法最有利于恢复基因之间的相关性结构.通过对基因表达水平数据的模拟,具体比较了几种常用标准化方法的效果,从而给出最有利于恢复基因之间相关性结构的那种标准化方法.
在基因芯片實驗中,基因錶達水平之間的相關性在推斷基因間相互關繫時起到非常重要的作用.未經標準化處理的芯片數據基因之間往往都呈現齣很彊的相關性,這些高相關性一部分是由基因錶達水平變化引起的,而另外一部分是由繫統偏差引起的.對芯片數據進行標準化處理的目的之一是消除繫統偏差引起的高相關性,同時保留由真正生物學原因引起的基因錶達水平高相關性.雖然目前對標準化方法已經有瞭不少比較研究,但還較少有人研究標準化方法對基因之間相關繫數的影響,以及哪種方法最有利于恢複基因之間的相關性結構.通過對基因錶達水平數據的模擬,具體比較瞭幾種常用標準化方法的效果,從而給齣最有利于恢複基因之間相關性結構的那種標準化方法.
재기인심편실험중,기인표체수평지간적상관성재추단기인간상호관계시기도비상중요적작용.미경표준화처리적심편수거기인지간왕왕도정현출흔강적상관성,저사고상관성일부분시유기인표체수평변화인기적,이령외일부분시유계통편차인기적.대심편수거진행표준화처리적목적지일시소제계통편차인기적고상관성,동시보류유진정생물학원인인기적기인표체수평고상관성.수연목전대표준화방법이경유료불소비교연구,단환교소유인연구표준화방법대기인지간상관계수적영향,이급나충방법최유리우회복기인지간적상관성결구.통과대기인표체수평수거적모의,구체비교료궤충상용표준화방법적효과,종이급출최유리우회복기인지간상관성결구적나충표준화방법.
