分析测试学报
分析測試學報
분석측시학보
JOURNAL OF INSTRUMENTAL ANALYSIS
2009年
2期
129-134
,共6页
张政希%莫凡%郭妍%徐学敏%林标扬%李伟
張政希%莫凡%郭妍%徐學敏%林標颺%李偉
장정희%막범%곽연%서학민%림표양%리위
卵巢癌%顺铂耐药性%IGROV-1/CP细胞系%miRNA%illumina测序技术
卵巢癌%順鉑耐藥性%IGROV-1/CP細胞繫%miRNA%illumina測序技術
란소암%순박내약성%IGROV-1/CP세포계%miRNA%illumina측서기술
从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illumina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序.从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类miRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞miRNA表达谱.以所获的序列长度与已知人类miRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件,共找到53种已知miRNA.按在cDNA文库测序中的出现频率计算,出现频率不大于10的低拷贝miRNA最多,占检测到所有miRNA种类的56.6%.说明illumina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息,该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系miRNA表达种类和相对丰度的实验数据.
從正常培養的IGROV-1/CP細胞中提取小RNA,構建小RNA的cDNA文庫,然後用illumina通用測序平檯對上述cDNA文庫進行測序.從測序穫得的序列數據中去除冗餘數據後,與已知人類miRNA序列數據庫進行比對,穫得IGROV-1/CP細胞miRNA錶達譜.以所穫的序列長度與已知人類miRNA數據庫中序列長度差異不大于2和無堿基錯配為限製條件,共找到53種已知miRNA.按在cDNA文庫測序中的齣現頻率計算,齣現頻率不大于10的低拷貝miRNA最多,佔檢測到所有miRNA種類的56.6%.說明illumina通用測序技術能夠在檢測細胞內的各種小RNA序列的同時反應相對豐度信息,該研究利用上述新技術穫得瞭順鉑耐藥性IGROV-1/CP細胞繫miRNA錶達種類和相對豐度的實驗數據.
종정상배양적IGROV-1/CP세포중제취소RNA,구건소RNA적cDNA문고,연후용illumina통용측서평태대상술cDNA문고진행측서.종측서획득적서렬수거중거제용여수거후,여이지인류miRNA서렬수거고진행비대,획득IGROV-1/CP세포miRNA표체보.이소획적서렬장도여이지인류miRNA수거고중서렬장도차이불대우2화무감기착배위한제조건,공조도53충이지miRNA.안재cDNA문고측서중적출현빈솔계산,출현빈솔불대우10적저고패miRNA최다,점검측도소유miRNA충류적56.6%.설명illumina통용측서기술능구재검측세포내적각충소RNA서렬적동시반응상대봉도신식,해연구이용상술신기술획득료순박내약성IGROV-1/CP세포계miRNA표체충류화상대봉도적실험수거.
