地质学报
地質學報
지질학보
ACTA GEOLOGICA SINICA
2010年
8期
1105-1111
,共7页
王峰%萨仁高娃%李铁刚%马学恩%于心科
王峰%薩仁高娃%李鐵剛%馬學恩%于心科
왕봉%살인고왜%리철강%마학은%우심과
西太平洋%16S rDNA%沉积物多样性
西太平洋%16S rDNA%沉積物多樣性
서태평양%16S rDNA%침적물다양성
以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱.据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析.结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B (11.8%)、Marine Benthic Group D (13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group (68.69%)为主.少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group (1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group (1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E (0.18%).以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落.
以提取併純化的西太平洋深海沉積物DNA為模闆,利用古菌PCR特異性引物擴增齣樣品中古菌的16S rDNA片段,構建其剋隆文庫,建立暘性剋隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切圖譜.據酶切圖譜對所穫得的120箇剋隆進行測序,併與數據庫中的序列進行比對,從而進行古菌的多樣性和繫統髮育分析.結果錶明,沉積物中擴增的16S rDNA古菌序列分彆來自泉古生菌(Crenarchaeota)和廣古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B (11.8%)、Marine Benthic Group D (13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group (68.69%)為主.少量序列為South African Gold Mine Euryarchaeotic Group (1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group (1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E (0.18%).以上結果錶明西太平洋深海沉積物中有豐富多樣的古菌群落.
이제취병순화적서태평양심해침적물DNA위모판,이용고균PCR특이성인물확증출양품중고균적16S rDNA편단,구건기극륭문고,건립양성극륭자RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)매절도보.거매절도보대소획득적120개극륭진행측서,병여수거고중적서렬진행비대,종이진행고균적다양성화계통발육분석.결과표명,침적물중확증적16S rDNA고균서렬분별래자천고생균(Crenarchaeota)화엄고생균(Euryarchaeota),이Marine Benthic Group B (11.8%)、Marine Benthic Group D (13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group (68.69%)위주.소량서렬위South African Gold Mine Euryarchaeotic Group (1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group (1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E (0.18%).이상결과표명서태평양심해침적물중유봉부다양적고균군락.
