植物保护
植物保護
식물보호
PLANT PROTECTION
2009年
2期
25-31
,共7页
岳红妮%吴宽%吴云锋%张珏%孙润红
嶽紅妮%吳寬%吳雲鋒%張玨%孫潤紅
악홍니%오관%오운봉%장각%손윤홍
泡桐丛枝植原体%Sec分泌蛋白转运系统%SecA,SecY和SecE亚基%生物信息学
泡桐叢枝植原體%Sec分泌蛋白轉運繫統%SecA,SecY和SecE亞基%生物信息學
포동총지식원체%Sec분비단백전운계통%SecA,SecY화SecE아기%생물신식학
采用PCR方法扩增Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,并进行了生物信息学分析.通过SWISS-MODEL同源建模与3D-PSSM折叠子识别法构建蛋白质的三维结构,并通过PROCHECK程序验证构建的三维结构的可靠性.首次从泡桐丛枝(PaWB)植原体基因组中分离出Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,各基因全长依次为2508、1 242 bp和411 bp,分别编码835、204个及136个氨基酸的蛋白.SecA、SecY和SecE均为脂溶性稳定蛋白,SecA无明显跨膜区,SecY和SecE分别含有10个和3个明显的疏水跨膜区.二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,没有转角.构建的三维结构符合立体化学原则.泡桐丛枝(PaWB)植原体中存在的Sec分泌蛋白转运系统作为最主要的运输途径,可能直接转运菌体蛋白如毒素等直接到寄主细胞质中或介体昆虫细胞中,引起寄主病症.研究植原体的Sec蛋白转运系统对于了解植原体的致病机理及预防这类病害的发生提供了理论依据.
採用PCR方法擴增Sec分泌蛋白轉運繫統3箇亞基基因,併進行瞭生物信息學分析.通過SWISS-MODEL同源建模與3D-PSSM摺疊子識彆法構建蛋白質的三維結構,併通過PROCHECK程序驗證構建的三維結構的可靠性.首次從泡桐叢枝(PaWB)植原體基因組中分離齣Sec分泌蛋白轉運繫統3箇亞基基因,各基因全長依次為2508、1 242 bp和411 bp,分彆編碼835、204箇及136箇氨基痠的蛋白.SecA、SecY和SecE均為脂溶性穩定蛋白,SecA無明顯跨膜區,SecY和SecE分彆含有10箇和3箇明顯的疏水跨膜區.二級結構主要為螺鏇,其次為摺疊和無規則捲麯,沒有轉角.構建的三維結構符閤立體化學原則.泡桐叢枝(PaWB)植原體中存在的Sec分泌蛋白轉運繫統作為最主要的運輸途徑,可能直接轉運菌體蛋白如毒素等直接到寄主細胞質中或介體昆蟲細胞中,引起寄主病癥.研究植原體的Sec蛋白轉運繫統對于瞭解植原體的緻病機理及預防這類病害的髮生提供瞭理論依據.
채용PCR방법확증Sec분비단백전운계통3개아기기인,병진행료생물신식학분석.통과SWISS-MODEL동원건모여3D-PSSM절첩자식별법구건단백질적삼유결구,병통과PROCHECK정서험증구건적삼유결구적가고성.수차종포동총지(PaWB)식원체기인조중분리출Sec분비단백전운계통3개아기기인,각기인전장의차위2508、1 242 bp화411 bp,분별편마835、204개급136개안기산적단백.SecA、SecY화SecE균위지용성은정단백,SecA무명현과막구,SecY화SecE분별함유10개화3개명현적소수과막구.이급결구주요위라선,기차위절첩화무규칙권곡,몰유전각.구건적삼유결구부합입체화학원칙.포동총지(PaWB)식원체중존재적Sec분비단백전운계통작위최주요적운수도경,가능직접전운균체단백여독소등직접도기주세포질중혹개체곤충세포중,인기기주병증.연구식원체적Sec단백전운계통대우료해식원체적치병궤리급예방저류병해적발생제공료이론의거.
