CAJ | 학술논문

采用PCR产物直接测序法获得圆斑星鲽(Verasper variegatus)和条斑星鲽(V.moseri)线粒体基因组的全部基因序列,并从GenBank中下载已知分类地位相关鱼类的线粒体基因的核苷酸序列和蛋白质氨基酸序列,用蛙、鸡、牛做外群,采用NJ和MP法,重建鱼类的系统发育树.通过计算各个基因在重建系统发育树时的准确率,估算该基因所含有的系统发育信息.结果表明,从氨基酸序列和核苷酸序列以及在目、科、属综合分析,这些基因的系统发育信息大致分为好(16S rRNA、ND2、ND4、12S rRNA、ND6、ND5)、中(Cytb、COⅡ、COⅢ、ND1、COⅠ)和差(ND3、ND4L、ATP6、ATP8)3个组.在目阶元,当用核苷酸序列分析时,12S rRNA、16S rRNA、COⅡ、ND4、ND5和ND6最好,COⅠ、COⅢ、Cytb、ND1和ND2为中等,而ND3、ATPase6、ATPase8和ND4L最差.当用氨基酸序列分析时,ND4和ND5最好,ND1、ND2、Cytb、ND6、COⅠ、COⅡ和ND4L为中等,ND3、ATPase6、COⅢ和ATPase8最差.在科阶元,当用核苷酸序列时,12S rRNA、16S rRNA、ND2和ND6系统发育信息最好;用氨基酸序列时,Cytb和ND2最好.在属阶元,所有基因的核苷酸序列都具有很好的系统发育信息,而COⅡ、ND4L、ND1和ND3的氨基酸序列系统发育信息最差.本研究结果有助于进一步利用线粒体基因研究分析鱼类系统进化关系.
채용PCR산물직접측서법획득원반성접(Verasper variegatus)화조반성접(V.moseri)선립체기인조적전부기인서렬,병종GenBank중하재이지분류지위상관어류적선립체기인적핵감산서렬화단백질안기산서렬,용와、계、우주외군,채용NJ화MP법,중건어류적계통발육수.통과계산각개기인재중건계통발육수시적준학솔,고산해기인소함유적계통발육신식.결과표명,종안기산서렬화핵감산서렬이급재목、과、속종합분석,저사기인적계통발육신식대치분위호(16S rRNA、ND2、ND4、12S rRNA、ND6、ND5)、중(Cytb、COⅡ、COⅢ、ND1、COⅠ)화차(ND3、ND4L、ATP6、ATP8)3개조.재목계원,당용핵감산서렬분석시,12S rRNA、16S rRNA、COⅡ、ND4、ND5화ND6최호,COⅠ、COⅢ、Cytb、ND1화ND2위중등,이ND3、ATPase6、ATPase8화ND4L최차.당용안기산서렬분석시,ND4화ND5최호,ND1、ND2、Cytb、ND6、COⅠ、COⅡ화ND4L위중등,ND3、ATPase6、COⅢ화ATPase8최차.재과계원,당용핵감산서렬시,12S rRNA、16S rRNA、ND2화ND6계통발육신식최호;용안기산서렬시,Cytb화ND2최호.재속계원,소유기인적핵감산서렬도구유흔호적계통발육신식,이COⅡ、ND4L、ND1화ND3적안기산서렬계통발육신식최차.본연구결과유조우진일보이용선립체기인연구분석어류계통진화관계.