复旦学报(自然科学版)
複旦學報(自然科學版)
복단학보(자연과학판)
JOURNAL OF FUDAN UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2000年
6期
645-650,655
,共7页
林盛榕%方雄英%应康%金华%王兆%谢毅%毛裕民
林盛榕%方雄英%應康%金華%王兆%謝毅%毛裕民
림성용%방웅영%응강%금화%왕조%사의%모유민
cDNA%RNA解旋酶%三维位置专一性得分矩阵%cDNA芯片
cDNA%RNA解鏇酶%三維位置專一性得分矩陣%cDNA芯片
cDNA%RNA해선매%삼유위치전일성득분구진%cDNA심편
一条长3446bp的人类新基因cDNA已从胎脑cDNA文库中被克隆.该cDNA克隆包含长2583bp的开放读框,推测编码一条长860个氨基酸残基的蛋白质,预测分子质量为96.8ku.通过同源性比较及profile搜索,预测氨基酸序列显示出DExH-BOX RNA解旋酶基因家族特有的7个保守基序及已知RNA解旋酶氨基酸序列的较高同源性,进一步通过建立蛋白质结构模型同已知RNA解旋酶结构的比较,可以认定其为一条人类RNA解旋酶基因家族新成员.通过该基因编码的氨基酸序列中基序ⅡD-E-V-H残基将其命名为DVH(DEVH-box Helicase).生物信息学手段结合DVH基因表达谱分析结果可推定DVH可能在胎儿发育过程中起作用.由于解旋酶基因家族同人类遗传疾病关系密切,以上结果可指导DVH基因的进一步功能研究并提示该基因作为疾病侯选基因的可能性.
一條長3446bp的人類新基因cDNA已從胎腦cDNA文庫中被剋隆.該cDNA剋隆包含長2583bp的開放讀框,推測編碼一條長860箇氨基痠殘基的蛋白質,預測分子質量為96.8ku.通過同源性比較及profile搜索,預測氨基痠序列顯示齣DExH-BOX RNA解鏇酶基因傢族特有的7箇保守基序及已知RNA解鏇酶氨基痠序列的較高同源性,進一步通過建立蛋白質結構模型同已知RNA解鏇酶結構的比較,可以認定其為一條人類RNA解鏇酶基因傢族新成員.通過該基因編碼的氨基痠序列中基序ⅡD-E-V-H殘基將其命名為DVH(DEVH-box Helicase).生物信息學手段結閤DVH基因錶達譜分析結果可推定DVH可能在胎兒髮育過程中起作用.由于解鏇酶基因傢族同人類遺傳疾病關繫密切,以上結果可指導DVH基因的進一步功能研究併提示該基因作為疾病侯選基因的可能性.
일조장3446bp적인류신기인cDNA이종태뇌cDNA문고중피극륭.해cDNA극륭포함장2583bp적개방독광,추측편마일조장860개안기산잔기적단백질,예측분자질량위96.8ku.통과동원성비교급profile수색,예측안기산서렬현시출DExH-BOX RNA해선매기인가족특유적7개보수기서급이지RNA해선매안기산서렬적교고동원성,진일보통과건립단백질결구모형동이지RNA해선매결구적비교,가이인정기위일조인류RNA해선매기인가족신성원.통과해기인편마적안기산서렬중기서ⅡD-E-V-H잔기장기명명위DVH(DEVH-box Helicase).생물신식학수단결합DVH기인표체보분석결과가추정DVH가능재태인발육과정중기작용.유우해선매기인가족동인류유전질병관계밀절,이상결과가지도DVH기인적진일보공능연구병제시해기인작위질병후선기인적가능성.