山东农业科学
山東農業科學
산동농업과학
SHANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2010年
12期
6-10
,共5页
高传庆%王可%黄庆华%韩虹
高傳慶%王可%黃慶華%韓虹
고전경%왕가%황경화%한홍
猪传染性胃肠炎病毒%S蛋白%二级结构%B细胞抗原表位
豬傳染性胃腸炎病毒%S蛋白%二級結構%B細胞抗原錶位
저전염성위장염병독%S단백%이급결구%B세포항원표위
以TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)基因组序列为基础,运用Gamier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测其S蛋白的二级结构,运用Kyte-Doolittle方法对S蛋白的亲水性进行分析,并分别运用Jameson-wolf方法和Kmlrd方法预测了其抗原指数和表面可及性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测了其B细胞抗原表位.结果显示,а螺旋数量少且分散,p折叠占据面积较大,柔性区域主要集中在N端第22～30、45～76、100～172、239～301、348～419、451～519、541～633、645～720、746～796、822～887、921～986、1052～1201、1239～1384、1434～1445区段.S蛋白可能的B细胞抗原位点是N端第20～32、44～54、69～78、97～106、635～655、781～803、949～994、1307～1 328、1 346～1 362、1 432～1 448区段,这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为S蛋白的抗原优势表位.
以TGEV(豬傳染性胃腸炎病毒)基因組序列為基礎,運用Gamier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法預測其S蛋白的二級結構,運用Kyte-Doolittle方法對S蛋白的親水性進行分析,併分彆運用Jameson-wolf方法和Kmlrd方法預測瞭其抗原指數和錶麵可及性,最後結閤吳玉章的方法綜閤分析預測瞭其B細胞抗原錶位.結果顯示,а螺鏇數量少且分散,p摺疊佔據麵積較大,柔性區域主要集中在N耑第22～30、45～76、100～172、239～301、348～419、451～519、541～633、645～720、746～796、822～887、921～986、1052～1201、1239～1384、1434～1445區段.S蛋白可能的B細胞抗原位點是N耑第20～32、44～54、69～78、97～106、635～655、781～803、949～994、1307～1 328、1 346～1 362、1 432～1 448區段,這些區段內部或附近都有柔性區域存在,可作為S蛋白的抗原優勢錶位.
이TGEV(저전염성위장염병독)기인조서렬위기출,운용Gamier-Robson、Chou-Fasman화Karplus-Schulz방법예측기S단백적이급결구,운용Kyte-Doolittle방법대S단백적친수성진행분석,병분별운용Jameson-wolf방법화Kmlrd방법예측료기항원지수화표면가급성,최후결합오옥장적방법종합분석예측료기B세포항원표위.결과현시,а라선수량소차분산,p절첩점거면적교대,유성구역주요집중재N단제22～30、45～76、100～172、239～301、348～419、451～519、541～633、645～720、746～796、822～887、921～986、1052～1201、1239～1384、1434～1445구단.S단백가능적B세포항원위점시N단제20～32、44～54、69～78、97～106、635～655、781～803、949～994、1307～1 328、1 346～1 362、1 432～1 448구단,저사구단내부혹부근도유유성구역존재,가작위S단백적항원우세표위.
