物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2012年
5期
1257-1264
,共8页
胡衍保%彭静波%顾硕%裴剑锋%邹忠梅
鬍衍保%彭靜波%顧碩%裴劍鋒%鄒忠梅
호연보%팽정파%고석%배검봉%추충매
分子对接%心可舒%中药复方%冠心病%多靶点作用%富集因子
分子對接%心可舒%中藥複方%冠心病%多靶點作用%富集因子
분자대접%심가서%중약복방%관심병%다파점작용%부집인자
心可舒为治疗冠心病的常用中药复方,临床疗效确切,但是其效应物质基础和作用机制一直没有得到明确的解释.本文以从心可舒中直接鉴定出的51个化学成分和过氧化物酶体增生物激活受体Y (PPAR-γ),血管紧张素｜转化酶(ACE),羟甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR),环氧合酶2(COX-2)以及凝血酶(thrombin)等5个冠心病相关靶点为研究对象,采用LibDock和AutoDock 2种分子对接程序联合对接的方法对以上化学成分和靶点的相互作用进行探讨.首先用均方根偏差(RMSD)和富集因子(EF)考察了2种程序对于5个靶点受体配体结合体系的适用性,进而发现当2种程序联合使用时,各靶点的富集因子较程序单独使用时有明显的提高,因而最终使用LibDock和AutoDock联合进行筛选.计算结果表明心可舒中的葛根苷A、葛根苷B、丹酚酸A和丹酚酸C4个化合物可能作用于2个或者2个以上的靶点,另外还有8个化合物能够分别作用于5个靶点的其中1个靶点.本研究初步阐释了心可舒多靶点作用的分子机制,为心可舒的后期开发提供了一定的参考.
心可舒為治療冠心病的常用中藥複方,臨床療效確切,但是其效應物質基礎和作用機製一直沒有得到明確的解釋.本文以從心可舒中直接鑒定齣的51箇化學成分和過氧化物酶體增生物激活受體Y (PPAR-γ),血管緊張素｜轉化酶(ACE),羥甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR),環氧閤酶2(COX-2)以及凝血酶(thrombin)等5箇冠心病相關靶點為研究對象,採用LibDock和AutoDock 2種分子對接程序聯閤對接的方法對以上化學成分和靶點的相互作用進行探討.首先用均方根偏差(RMSD)和富集因子(EF)攷察瞭2種程序對于5箇靶點受體配體結閤體繫的適用性,進而髮現噹2種程序聯閤使用時,各靶點的富集因子較程序單獨使用時有明顯的提高,因而最終使用LibDock和AutoDock聯閤進行篩選.計算結果錶明心可舒中的葛根苷A、葛根苷B、丹酚痠A和丹酚痠C4箇化閤物可能作用于2箇或者2箇以上的靶點,另外還有8箇化閤物能夠分彆作用于5箇靶點的其中1箇靶點.本研究初步闡釋瞭心可舒多靶點作用的分子機製,為心可舒的後期開髮提供瞭一定的參攷.
심가서위치료관심병적상용중약복방,림상료효학절,단시기효응물질기출화작용궤제일직몰유득도명학적해석.본문이종심가서중직접감정출적51개화학성분화과양화물매체증생물격활수체Y (PPAR-γ),혈관긴장소｜전화매(ACE),간갑기무이선보매A환원매(HMGR),배양합매2(COX-2)이급응혈매(thrombin)등5개관심병상관파점위연구대상,채용LibDock화AutoDock 2충분자대접정서연합대접적방법대이상화학성분화파점적상호작용진행탐토.수선용균방근편차(RMSD)화부집인자(EF)고찰료2충정서대우5개파점수체배체결합체계적괄용성,진이발현당2충정서연합사용시,각파점적부집인자교정서단독사용시유명현적제고,인이최종사용LibDock화AutoDock연합진행사선.계산결과표명심가서중적갈근감A、갈근감B、단분산A화단분산C4개화합물가능작용우2개혹자2개이상적파점,령외환유8개화합물능구분별작용우5개파점적기중1개파점.본연구초보천석료심가서다파점작용적분자궤제,위심가서적후기개발제공료일정적삼고.
