厦门大学学报(自然科学版)
廈門大學學報(自然科學版)
하문대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF XIAMEN UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE)
2004年
z1期
113-118
,共6页
双链置换探针%实时PCR%DNA池%等位基因频率
雙鏈置換探針%實時PCR%DNA池%等位基因頻率
쌍련치환탐침%실시PCR%DNA지%등위기인빈솔
结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法.该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率.实验以β-地中海贫血CDs41-42(-TCTT)突变为对象,分别用荧光染料FAM和ROX标记野生型和突变型探针,由实时PCR检测建立的等位基因浓度与循环阈值的响应曲线计算DNA池的等位基因频率.结果表明,建立的系列等位基因浓度与循环阈值呈线性关系,线性相关系数分别为0.997 7(野生型等位基因)和0.993 8(突变型等位基因),可检测的最低等位基因频率达1%,等位基因频率在1%~90%范围内测定误差小于4%.该方法可广泛用于流行病学调查、遗传连锁分析以及全基因组连锁不平衡扫描等领域.
結閤熒光雙鏈置換探針的特異性和實時PCR的準確定量能力,建立瞭一種新穎、準確、價廉且高通量的測定DNA池等位基因頻率的方法.該方法採用不同熒光標記的雙鏈置換探針1次PCR反應即可測定齣等位基因頻率.實驗以β-地中海貧血CDs41-42(-TCTT)突變為對象,分彆用熒光染料FAM和ROX標記野生型和突變型探針,由實時PCR檢測建立的等位基因濃度與循環閾值的響應麯線計算DNA池的等位基因頻率.結果錶明,建立的繫列等位基因濃度與循環閾值呈線性關繫,線性相關繫數分彆為0.997 7(野生型等位基因)和0.993 8(突變型等位基因),可檢測的最低等位基因頻率達1%,等位基因頻率在1%~90%範圍內測定誤差小于4%.該方法可廣汎用于流行病學調查、遺傳連鎖分析以及全基因組連鎖不平衡掃描等領域.
결합형광쌍련치환탐침적특이성화실시PCR적준학정량능력,건립료일충신영、준학、개렴차고통량적측정DNA지등위기인빈솔적방법.해방법채용불동형광표기적쌍련치환탐침1차PCR반응즉가측정출등위기인빈솔.실험이β-지중해빈혈CDs41-42(-TCTT)돌변위대상,분별용형광염료FAM화ROX표기야생형화돌변형탐침,유실시PCR검측건립적등위기인농도여순배역치적향응곡선계산DNA지적등위기인빈솔.결과표명,건립적계렬등위기인농도여순배역치정선성관계,선성상관계수분별위0.997 7(야생형등위기인)화0.993 8(돌변형등위기인),가검측적최저등위기인빈솔체1%,등위기인빈솔재1%~90%범위내측정오차소우4%.해방법가엄범용우류행병학조사、유전련쇄분석이급전기인조련쇄불평형소묘등영역.