中国南方果树
中國南方果樹
중국남방과수
SOUTH CHINA FRUITS
2011年
3期
1-5,10
,共6页
王金萍%宋二玲%姚利晓%李凤龙%何永睿%陈善春
王金萍%宋二玲%姚利曉%李鳳龍%何永睿%陳善春
왕금평%송이령%요리효%리봉룡%하영예%진선춘
cDNA文库%根%资阳香橙%表达序列标签%测序
cDNA文庫%根%資暘香橙%錶達序列標籤%測序
cDNA문고%근%자양향등%표체서렬표첨%측서
以资阳香橙根RNA为材料,采用SMART技术构建了cDNA全长文库,并对其质量进行鉴定.结果显示,该文库的库容量为4.8×105pfu/mL,重组率为93%,文库插入片段大小主要集中在0.5～1.0kb.从文库中随机挑取450个克隆进行5′端单向测序,去除载体序列及低质量的序列后,共获得有效长度大于150 bp的高质量ESTs(expressed sequence tags)序列438条,利用BioEdit软件对有效ESTs序列进行片段重叠群分析和拼接后,获得251个独立基因(Unigenes),其中包括87个片段重叠群(Contigs)和164个独立的ESTs(Singlets);通过与NCBI的非冗余核酸数据库进行tBLASTx比对,初步确定已知功能基因146个,未知功能基因91个,另有14个unigene未与数据库中序列匹配.该研究为进一步分离克隆资阳香橙根部功能基因奠定了基础.
以資暘香橙根RNA為材料,採用SMART技術構建瞭cDNA全長文庫,併對其質量進行鑒定.結果顯示,該文庫的庫容量為4.8×105pfu/mL,重組率為93%,文庫插入片段大小主要集中在0.5～1.0kb.從文庫中隨機挑取450箇剋隆進行5′耑單嚮測序,去除載體序列及低質量的序列後,共穫得有效長度大于150 bp的高質量ESTs(expressed sequence tags)序列438條,利用BioEdit軟件對有效ESTs序列進行片段重疊群分析和拼接後,穫得251箇獨立基因(Unigenes),其中包括87箇片段重疊群(Contigs)和164箇獨立的ESTs(Singlets);通過與NCBI的非冗餘覈痠數據庫進行tBLASTx比對,初步確定已知功能基因146箇,未知功能基因91箇,另有14箇unigene未與數據庫中序列匹配.該研究為進一步分離剋隆資暘香橙根部功能基因奠定瞭基礎.
이자양향등근RNA위재료,채용SMART기술구건료cDNA전장문고,병대기질량진행감정.결과현시,해문고적고용량위4.8×105pfu/mL,중조솔위93%,문고삽입편단대소주요집중재0.5～1.0kb.종문고중수궤도취450개극륭진행5′단단향측서,거제재체서렬급저질량적서렬후,공획득유효장도대우150 bp적고질량ESTs(expressed sequence tags)서렬438조,이용BioEdit연건대유효ESTs서렬진행편단중첩군분석화병접후,획득251개독립기인(Unigenes),기중포괄87개편단중첩군(Contigs)화164개독립적ESTs(Singlets);통과여NCBI적비용여핵산수거고진행tBLASTx비대,초보학정이지공능기인146개,미지공능기인91개,령유14개unigene미여수거고중서렬필배.해연구위진일보분리극륭자양향등근부공능기인전정료기출.
