生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2011年
4期
299-302
,共4页
詹少华%尹艺林%蔡永萍%樊洪泓%林毅
詹少華%尹藝林%蔡永萍%樊洪泓%林毅
첨소화%윤예림%채영평%번홍홍%림의
VBA%序列比对%保守序列%核酸数据库%大豆
VBA%序列比對%保守序列%覈痠數據庫%大豆
VBA%서렬비대%보수서렬%핵산수거고%대두
采用VBA编写了查找核酸数据库保守序列的四个相关程序,“导入DNA序列”程序可以将Fasta格式的DNA序列文本文件存放到Excel Sheetl的A列中,保留每个序列的Gi号,删除多余的注释部分；“整理DNA序列”程序可以将DNA序列Gi号存放到A列中,B列为对应Gi号的完整序列；“DNA随机序列”程序可以产生DNA随机序列；“发现DNA保守序列”程序可以将随机序列与下载的DNA序列比对,查找每一种随机序列的出现频率.以大豆基因组序列为实例,说明了这些程序的应用方法.该程序弥补了流行序列比对软件的不足,为PCR设计引物、分析基因功能以及种质资源鉴定等方面提供新的工具.
採用VBA編寫瞭查找覈痠數據庫保守序列的四箇相關程序,“導入DNA序列”程序可以將Fasta格式的DNA序列文本文件存放到Excel Sheetl的A列中,保留每箇序列的Gi號,刪除多餘的註釋部分；“整理DNA序列”程序可以將DNA序列Gi號存放到A列中,B列為對應Gi號的完整序列；“DNA隨機序列”程序可以產生DNA隨機序列；“髮現DNA保守序列”程序可以將隨機序列與下載的DNA序列比對,查找每一種隨機序列的齣現頻率.以大豆基因組序列為實例,說明瞭這些程序的應用方法.該程序瀰補瞭流行序列比對軟件的不足,為PCR設計引物、分析基因功能以及種質資源鑒定等方麵提供新的工具.
채용VBA편사료사조핵산수거고보수서렬적사개상관정서,“도입DNA서렬”정서가이장Fasta격식적DNA서렬문본문건존방도Excel Sheetl적A렬중,보류매개서렬적Gi호,산제다여적주석부분；“정리DNA서렬”정서가이장DNA서렬Gi호존방도A렬중,B렬위대응Gi호적완정서렬；“DNA수궤서렬”정서가이산생DNA수궤서렬；“발현DNA보수서렬”정서가이장수궤서렬여하재적DNA서렬비대,사조매일충수궤서렬적출현빈솔.이대두기인조서렬위실례,설명료저사정서적응용방법.해정서미보료류행서렬비대연건적불족,위PCR설계인물、분석기인공능이급충질자원감정등방면제공신적공구.
