华西医学
華西醫學
화서의학
WEST CHINA MEDICAL JOURNAL
2007年
1期
105-107
,共3页
彭枫%杨寒朔%邓洪新%王瑞%杨金亮%田聆%魏于全
彭楓%楊寒朔%鄧洪新%王瑞%楊金亮%田聆%魏于全
팽풍%양한삭%산홍신%왕서%양금량%전령%위우전
大鼠新基因%生物信息学%基因功能预测
大鼠新基因%生物信息學%基因功能預測
대서신기인%생물신식학%기인공능예측
目的: 为进一步研究我们克隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示.方法: 应用B1ast、ORF Finder、ScanProsite、TMpred Server和UniGene等软件或数据库,进行序列的相似性比较,开放读码框预测、染色体定位、电子表达谱和编码蛋白质的功能等分析.结果: 我们得到的Rtap2a序列是该基因的全长cDNA序列,在多物种间高度保守,该基因编码的蛋白可能为一N端在胞内的单次跨膜蛋白;其小鼠同源基因的电子表达谱提示Rtap2a特异地高表达于睾丸组织,在成年小鼠的睾丸中表达量最高.结论: 大鼠新基因Rtap2a是一睾丸限制性表达的新基因,其编码蛋白单次跨膜,进化上高度保守,可能在哺乳动物的睾丸发育和精子发生过程中具有重要功能,也有可能参与肿瘤的发生、发展等过程.因此,新基因Rtap2a有进一步研究的价值.
目的: 為進一步研究我們剋隆到的大鼠新基因Rtap2a,本研究採用多種生物信息學方法對該序列進行特徵分析和功能預測,以穫得該基因及其編碼蛋白更多的功能提示.方法: 應用B1ast、ORF Finder、ScanProsite、TMpred Server和UniGene等軟件或數據庫,進行序列的相似性比較,開放讀碼框預測、染色體定位、電子錶達譜和編碼蛋白質的功能等分析.結果: 我們得到的Rtap2a序列是該基因的全長cDNA序列,在多物種間高度保守,該基因編碼的蛋白可能為一N耑在胞內的單次跨膜蛋白;其小鼠同源基因的電子錶達譜提示Rtap2a特異地高錶達于睪汍組織,在成年小鼠的睪汍中錶達量最高.結論: 大鼠新基因Rtap2a是一睪汍限製性錶達的新基因,其編碼蛋白單次跨膜,進化上高度保守,可能在哺乳動物的睪汍髮育和精子髮生過程中具有重要功能,也有可能參與腫瘤的髮生、髮展等過程.因此,新基因Rtap2a有進一步研究的價值.
목적: 위진일보연구아문극륭도적대서신기인Rtap2a,본연구채용다충생물신식학방법대해서렬진행특정분석화공능예측,이획득해기인급기편마단백경다적공능제시.방법: 응용B1ast、ORF Finder、ScanProsite、TMpred Server화UniGene등연건혹수거고,진행서렬적상사성비교,개방독마광예측、염색체정위、전자표체보화편마단백질적공능등분석.결과: 아문득도적Rtap2a서렬시해기인적전장cDNA서렬,재다물충간고도보수,해기인편마적단백가능위일N단재포내적단차과막단백;기소서동원기인적전자표체보제시Rtap2a특이지고표체우고환조직,재성년소서적고환중표체량최고.결론: 대서신기인Rtap2a시일고환한제성표체적신기인,기편마단백단차과막,진화상고도보수,가능재포유동물적고환발육화정자발생과정중구유중요공능,야유가능삼여종류적발생、발전등과정.인차,신기인Rtap2a유진일보연구적개치.
