种子
種子
충자
SEED
2010年
9期
1-6,12
,共7页
陆景标%李杰勤%卢杰%詹秋文
陸景標%李傑勤%盧傑%詹鞦文
륙경표%리걸근%로걸%첨추문
高粱%非编码区%SSR%e-PCR%多态性
高粱%非編碼區%SSR%e-PCR%多態性
고량%비편마구%SSR%e-PCR%다태성
本研究通过在NCBI公共数据库的高粱全基因序列中进行简单重复序列SSR搜索,结果显示共有87950个SSR位点,共有1134种重复,其中二元碱基和三元碱基重复所占比例最大,分别占43.36%,32.38%.根据SSR搜索结果设计了高粱SSR引物,通过两次e-PCR验证和筛选引物,随机合成了50对引物.以先锋和乐食两个高丹草品种为材料进行引物的筛选和评价.结果表明,50对引物中有46对引物出带,但只有8对引物具有多态性.这说明在高粱非编码区设计的引物多态性并不高于EST-SSR引物,但对高粱的SSR引物的开发可以起到补充和促进作用.
本研究通過在NCBI公共數據庫的高粱全基因序列中進行簡單重複序列SSR搜索,結果顯示共有87950箇SSR位點,共有1134種重複,其中二元堿基和三元堿基重複所佔比例最大,分彆佔43.36%,32.38%.根據SSR搜索結果設計瞭高粱SSR引物,通過兩次e-PCR驗證和篩選引物,隨機閤成瞭50對引物.以先鋒和樂食兩箇高丹草品種為材料進行引物的篩選和評價.結果錶明,50對引物中有46對引物齣帶,但隻有8對引物具有多態性.這說明在高粱非編碼區設計的引物多態性併不高于EST-SSR引物,但對高粱的SSR引物的開髮可以起到補充和促進作用.
본연구통과재NCBI공공수거고적고량전기인서렬중진행간단중복서렬SSR수색,결과현시공유87950개SSR위점,공유1134충중복,기중이원감기화삼원감기중복소점비례최대,분별점43.36%,32.38%.근거SSR수색결과설계료고량SSR인물,통과량차e-PCR험증화사선인물,수궤합성료50대인물.이선봉화악식량개고단초품충위재료진행인물적사선화평개.결과표명,50대인물중유46대인물출대,단지유8대인물구유다태성.저설명재고량비편마구설계적인물다태성병불고우EST-SSR인물,단대고량적SSR인물적개발가이기도보충화촉진작용.
