CAJ | 학술논문

中国明对虾肝胰腺细小病毒是一种单链、线性DNA病毒.本研究利用DNA末端加尾和嵌套PCR首次完成了对虾肝胰腺细小病毒(hepatopancreatic parvovirus,HPV)中国分离株(HPV-Pc)全基因组序列的测定,研究结果表明,HPV-Pc株(GenBank登录号GU371276)的全基因组由6085个核苷酸组成,包含3个开放阅读框(ORF)(分别代表ns1、ns2和cp基因)和2个非编码区.ORF1、ORF2和ORF3分别编码由427、578和821个氨基酸组成的蛋白,分子量分别为50.4 kD、68.2 kD和92 kD.分析HPV-Pc基因组结构,发现该基因组没有末端反向重复序列(ITR),cp基因编码的CP区有HPV特异的"GAA"正向重复序列,及富含甘氨酸的上游和下游不同位置存在精氯酸残基,可造成蛋白裂解.不同地区、不同对虾HPV基因组有较大差异,HPV-Pc株基因组与其他已知HPV序列同源性在78%～91%之间,差异遍布整个序列中.将HPV-Pc各基因片段与已报道的其他地区HPV相应序列进行比较,结果表明,HPV-Pc各基因片段与AY008257(韩国株)同源性最高.与已知HPV代表株的NS2、NS1和CP蛋白氨基酸序列同源性比较也显示,HPV-Pc株与韩国株同源性最高.这些特征表明HPV-Pc属于细小病毒科的一个新分离株.
중국명대하간이선세소병독시일충단련、선성DNA병독.본연구이용DNA말단가미화감투PCR수차완성료대하간이선세소병독(hepatopancreatic parvovirus,HPV)중국분리주(HPV-Pc)전기인조서렬적측정,연구결과표명,HPV-Pc주(GenBank등록호GU371276)적전기인조유6085개핵감산조성,포함3개개방열독광(ORF)(분별대표ns1、ns2화cp기인)화2개비편마구.ORF1、ORF2화ORF3분별편마유427、578화821개안기산조성적단백,분자량분별위50.4 kD、68.2 kD화92 kD.분석HPV-Pc기인조결구,발현해기인조몰유말단반향중복서렬(ITR),cp기인편마적CP구유HPV특이적"GAA"정향중복서렬,급부함감안산적상유화하유불동위치존재정록산잔기,가조성단백렬해.불동지구、불동대하HPV기인조유교대차이,HPV-Pc주기인조여기타이지HPV서렬동원성재78%～91%지간,차이편포정개서렬중.장HPV-Pc각기인편단여이보도적기타지구HPV상응서렬진행비교,결과표명,HPV-Pc각기인편단여AY008257(한국주)동원성최고.여이지HPV대표주적NS2、NS1화CP단백안기산서렬동원성비교야현시,HPV-Pc주여한국주동원성최고.저사특정표명HPV-Pc속우세소병독과적일개신분리주.