CAJ | 학술논문

本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp.挑取cDNA克隆进行5'端测序,总共进行了1571个成功反应,其中1411条ESTs长度大于100bp,初步拼接得到939个单基因簇( Unigene),其中包括188个重叠群(Contigs),751个单拷贝EST(Singletons).使用BLA ST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、查询和注释,结果显示418条序列有相关同源性,其他的521(55.5%)条序列没有明显的同源性(E-valu(≤＝)1.00E-10),但是也同时揭示出在这些ESTs中能够发现新功能基因的相当可能性.本研究结果对草鱼以及其他鲤科鱼类的消化系统功能基因的筛选和发现具有指导意义.此外,草鱼肠道cDNA文库的构建和EST测序工作将为草鱼基因组计划的实施奠定基础.
본항연구이자성초어장도위실험재료,채용비균일화적Oligo-dT인물정향극륭기술구건료초어장도조직적cDNA문고,대문고질량적분석결과표명:cDNA문고적고용량지소위2.3×105,중조솔체95%,평균삽입편단장도대우1000bp.도취cDNA극륭진행5'단측서,총공진행료1571개성공반응,기중1411조ESTs장도대우100bp,초보병접득도939개단기인족( Unigene),기중포괄188개중첩군(Contigs),751개단고패EST(Singletons).사용BLA ST연건장저사서렬동GenBank등수거고진행비대、사순화주석,결과현시418조서렬유상관동원성,기타적521(55.5%)조서렬몰유명현적동원성(E-valu(≤＝)1.00E-10),단시야동시게시출재저사ESTs중능구발현신공능기인적상당가능성.본연구결과대초어이급기타리과어류적소화계통공능기인적사선화발현구유지도의의.차외,초어장도cDNA문고적구건화EST측서공작장위초어기인조계화적실시전정기출.