中山大学学报（医学科学版）
中山大學學報（醫學科學版）
중산대학학보（의학과학판）
JOURNAL OF SUN YAT-SEN UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2012年
4期
454-459
,共6页
黄怀球%钟毅%赵静%张静%孙九峰%张晓辉%袁立燕
黃懷毬%鐘毅%趙靜%張靜%孫九峰%張曉輝%袁立燕
황부구%종의%조정%장정%손구봉%장효휘%원립연
申克孢子丝菌%翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)%生物信息学
申剋孢子絲菌%翻譯控製腫瘤蛋白(TCTP)%生物信息學
신극포자사균%번역공제종류단백(TCTP)%생물신식학
[目的]从cDNA文库中识别申克孢子丝菌翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)的基因并分析预测其结构功能和应用前景.[方法]利用NCBI和ExPASy网站中的各种基因和蛋白的序列结构信息分析工具,结合DNAstar和VectorNTI suite生物信息学分析软件包,从申克孢子丝菌全长cDNA质粒文库中识别TCTP的基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白结构特征和功能.[结果]TCTP基因全长621 bp,编码区具有207个氨基酸.在GenBank同源序列中,其与蓝菌属真菌(Grosmannia clavigera)TCTP氨基酸序列一致性达到78％.理论预测分子质量为64581.4 ku.无质体和线粒体定位序列.预测结果显示编码蛋白含有1个跨膜区、7个亲水性部位和5个主要B细胞表位.与蓝菌属真菌及球毛壳霉(C.globosum)的TCTP进化关系最近.[结论]应用生物信息方法筛选出申克孢子丝菌TCTP的cDNA全长序列并预测其结构与功能、潜在抗原表位,为进一步实验研究该蛋白生物学特性提供了依据.
[目的]從cDNA文庫中識彆申剋孢子絲菌翻譯控製腫瘤蛋白(TCTP)的基因併分析預測其結構功能和應用前景.[方法]利用NCBI和ExPASy網站中的各種基因和蛋白的序列結構信息分析工具,結閤DNAstar和VectorNTI suite生物信息學分析軟件包,從申剋孢子絲菌全長cDNA質粒文庫中識彆TCTP的基因及其編碼區,分析、預測該基因編碼的蛋白結構特徵和功能.[結果]TCTP基因全長621 bp,編碼區具有207箇氨基痠.在GenBank同源序列中,其與藍菌屬真菌(Grosmannia clavigera)TCTP氨基痠序列一緻性達到78％.理論預測分子質量為64581.4 ku.無質體和線粒體定位序列.預測結果顯示編碼蛋白含有1箇跨膜區、7箇親水性部位和5箇主要B細胞錶位.與藍菌屬真菌及毬毛殼黴(C.globosum)的TCTP進化關繫最近.[結論]應用生物信息方法篩選齣申剋孢子絲菌TCTP的cDNA全長序列併預測其結構與功能、潛在抗原錶位,為進一步實驗研究該蛋白生物學特性提供瞭依據.
[목적]종cDNA문고중식별신극포자사균번역공제종류단백(TCTP)적기인병분석예측기결구공능화응용전경.[방법]이용NCBI화ExPASy망참중적각충기인화단백적서렬결구신식분석공구,결합DNAstar화VectorNTI suite생물신식학분석연건포,종신극포자사균전장cDNA질립문고중식별TCTP적기인급기편마구,분석、예측해기인편마적단백결구특정화공능.[결과]TCTP기인전장621 bp,편마구구유207개안기산.재GenBank동원서렬중,기여람균속진균(Grosmannia clavigera)TCTP안기산서렬일치성체도78％.이론예측분자질량위64581.4 ku.무질체화선립체정위서렬.예측결과현시편마단백함유1개과막구、7개친수성부위화5개주요B세포표위.여람균속진균급구모각매(C.globosum)적TCTP진화관계최근.[결론]응용생물신식방법사선출신극포자사균TCTP적cDNA전장서렬병예측기결구여공능、잠재항원표위,위진일보실험연구해단백생물학특성제공료의거.
