中华微生物学和免疫学杂志
中華微生物學和免疫學雜誌
중화미생물학화면역학잡지
CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
2006年
8期
739-742
,共4页
蒋盛军%纪绍忠%唐青%杨红彦%崔晓英%毕烨%阚飙%高守一
蔣盛軍%紀紹忠%唐青%楊紅彥%崔曉英%畢燁%闞飆%高守一
장성군%기소충%당청%양홍언%최효영%필엽%감표%고수일
新成人腹泻轮状病毒%J19株%基因%克隆%序列分析
新成人腹瀉輪狀病毒%J19株%基因%剋隆%序列分析
신성인복사륜상병독%J19주%기인%극륭%서렬분석
目的 进一步了解新的成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因特征.方法 利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增新的成人腹泻轮状病毒J19株的VP1基因,克隆至pMD18-T中并进行测序.利用DNAStar和PHYLIP软件包进行序列之间的比较分析并绘制系统发生树.结果 J19株的VP1基因为基因1,全长3538个核苷酸,编码1167个氨基酸.氨基酸序列同源性分析表明J19株的VP1蛋白序列对B组轮状病毒IDIR株的一致性为55.7%,对A组轮状病毒SA11株和C组轮状病毒Bristol株的一致性分别为20.4%、19.2%.对J19株的VP1蛋白序列的遗传进化分析表明,J19株在系统发生树上的位置是靠近外群蛋白并靠近A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支.结论 J19株的VP1蛋白序列与其他轮状病毒的VP1蛋白序列存在显著差异.J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一.
目的 進一步瞭解新的成人腹瀉輪狀病毒J19株依賴RNA的RNA聚閤酶基因特徵.方法 利用一種改良的非依賴覈痠序列的單引物擴增方法擴增新的成人腹瀉輪狀病毒J19株的VP1基因,剋隆至pMD18-T中併進行測序.利用DNAStar和PHYLIP軟件包進行序列之間的比較分析併繪製繫統髮生樹.結果 J19株的VP1基因為基因1,全長3538箇覈苷痠,編碼1167箇氨基痠.氨基痠序列同源性分析錶明J19株的VP1蛋白序列對B組輪狀病毒IDIR株的一緻性為55.7%,對A組輪狀病毒SA11株和C組輪狀病毒Bristol株的一緻性分彆為20.4%、19.2%.對J19株的VP1蛋白序列的遺傳進化分析錶明,J19株在繫統髮生樹上的位置是靠近外群蛋白併靠近A、B和C組輪狀病毒分支的根部,而且它比較偏嚮于B組輪狀病毒的分支.結論 J19株的VP1蛋白序列與其他輪狀病毒的VP1蛋白序列存在顯著差異.J19株可能是一箇與B組輪狀病毒的起源和進化密切相關的毒株之一.
목적 진일보료해신적성인복사륜상병독J19주의뢰RNA적RNA취합매기인특정.방법 이용일충개량적비의뢰핵산서렬적단인물확증방법확증신적성인복사륜상병독J19주적VP1기인,극륭지pMD18-T중병진행측서.이용DNAStar화PHYLIP연건포진행서렬지간적비교분석병회제계통발생수.결과 J19주적VP1기인위기인1,전장3538개핵감산,편마1167개안기산.안기산서렬동원성분석표명J19주적VP1단백서렬대B조륜상병독IDIR주적일치성위55.7%,대A조륜상병독SA11주화C조륜상병독Bristol주적일치성분별위20.4%、19.2%.대J19주적VP1단백서렬적유전진화분석표명,J19주재계통발생수상적위치시고근외군단백병고근A、B화C조륜상병독분지적근부,이차타비교편향우B조륜상병독적분지.결론 J19주적VP1단백서렬여기타륜상병독적VP1단백서렬존재현저차이.J19주가능시일개여B조륜상병독적기원화진화밀절상관적독주지일.
