CAJ | 학술논문

根据GenBank文献,应用Oligo 6.0分析软件设计合成了用于扩增鸭Ⅰ型干扰素(α-IFN)基因的2对引物,以麻鸭肝脏提取的基因组DNA为模板,采用Nest-PCR方法扩增获得了约600 bp片段,经T载体克隆和测序分析证实,是麻鸭Ⅰ型干扰素基因(SDIFN-α).生物信息学分析表明,SDIFN-α的开放阅读框架(ORF)由576个核苷酸所组成,预测蛋白质相对分子质量为21 640,编码191个氨基酸,其中前28个氨基酸可能是信号肽部分,切割位点在28号氨基酸A和29号氨基酸S之间,序列中无内含子.成熟的多肽中含8个半胱氨酸和2个糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点(protein kinase C phosphorylation site)和2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(casein kinase Ⅱ phosphorylation site).SDIFN-α与鸭α-IFN基因核苷酸同源性为99.3%,有4个碱基的差异;与北京鸭α-IFN基因的核苷酸同源性为99.1%,氨基酸同源性为98.96%;与鸡α-IFN的核苷酸同源性为71.8%.与鹅、狗、牛、马和人的α-IFN基因的核苷酸同源性分别为96.0%、45.8%、45.5%、44.6%和41.7%.遗传进化分析结果表明,IFN-α的这些同源性与其动物分类地位相一致.
근거GenBank문헌,응용Oligo 6.0분석연건설계합성료용우확증압Ⅰ형간우소(α-IFN)기인적2대인물,이마압간장제취적기인조DNA위모판,채용Nest-PCR방법확증획득료약600 bp편단,경T재체극륭화측서분석증실,시마압Ⅰ형간우소기인(SDIFN-α).생물신식학분석표명,SDIFN-α적개방열독광가(ORF)유576개핵감산소조성,예측단백질상대분자질량위21 640,편마191개안기산,기중전28개안기산가능시신호태부분,절할위점재28호안기산A화29호안기산S지간,서렬중무내함자.성숙적다태중함8개반광안산화2개당기화위점,2개단백격매C린산화위점(protein kinase C phosphorylation site)화2개락단백격매Ⅱ린산화위점(casein kinase Ⅱ phosphorylation site).SDIFN-α여압α-IFN기인핵감산동원성위99.3%,유4개감기적차이;여북경압α-IFN기인적핵감산동원성위99.1%,안기산동원성위98.96%;여계α-IFN적핵감산동원성위71.8%.여아、구、우、마화인적α-IFN기인적핵감산동원성분별위96.0%、45.8%、45.5%、44.6%화41.7%.유전진화분석결과표명,IFN-α적저사동원성여기동물분류지위상일치.