东北农业大学学报
東北農業大學學報
동북농업대학학보
JOURNAL OF NORTHEAST AGRICULTURAL UNIVERSITY
2010年
5期
112-120
,共9页
鞠会艳%乔军%高玉伟%杨松涛%夏咸柱
鞠會豔%喬軍%高玉偉%楊鬆濤%夏鹹柱
국회염%교군%고옥위%양송도%하함주
犬瘟热病毒小熊猫株%核蛋白和融合蛋白基因%克隆%序列分析
犬瘟熱病毒小熊貓株%覈蛋白和融閤蛋白基因%剋隆%序列分析
견온열병독소웅묘주%핵단백화융합단백기인%극륭%서렬분석
根据GenBank中报道的CDV核苷酸序列,设计合成了2对特异性引物,对犬瘟热病毒小熊猫株(CDV LP)核蛋白(N)和融合蛋白(F)两种主要结构蛋白基因进行了克隆、测序及序列分析.结果表明,CDV LP株N蛋白基因全长1571 bp,预测编码523个氨基酸;F蛋白基因全长1989 bp,预测编码662个氨基酸.F蛋白氨基酸序列中含有5个潜在的N-联糖基化位点.聚类分析提示,CDV LP株是一株与CDV强毒株亲源关系很近的毒株.用DNAstar软件对CDV LP株和Onderstepoort弱毒株N蛋白和F蛋白进行了疏水性及抗原表位预测分析.抗原表位差异提示CDV LP毒株N和F蛋白的免疫原性可能要优于Onderstepoort弱毒株.在分子水平上阐明了CDV LP株的N和F蛋白基因更适合作为构建基因疫苗和重组活载体疫苗的目的基因.
根據GenBank中報道的CDV覈苷痠序列,設計閤成瞭2對特異性引物,對犬瘟熱病毒小熊貓株(CDV LP)覈蛋白(N)和融閤蛋白(F)兩種主要結構蛋白基因進行瞭剋隆、測序及序列分析.結果錶明,CDV LP株N蛋白基因全長1571 bp,預測編碼523箇氨基痠;F蛋白基因全長1989 bp,預測編碼662箇氨基痠.F蛋白氨基痠序列中含有5箇潛在的N-聯糖基化位點.聚類分析提示,CDV LP株是一株與CDV彊毒株親源關繫很近的毒株.用DNAstar軟件對CDV LP株和Onderstepoort弱毒株N蛋白和F蛋白進行瞭疏水性及抗原錶位預測分析.抗原錶位差異提示CDV LP毒株N和F蛋白的免疫原性可能要優于Onderstepoort弱毒株.在分子水平上闡明瞭CDV LP株的N和F蛋白基因更適閤作為構建基因疫苗和重組活載體疫苗的目的基因.
근거GenBank중보도적CDV핵감산서렬,설계합성료2대특이성인물,대견온열병독소웅묘주(CDV LP)핵단백(N)화융합단백(F)량충주요결구단백기인진행료극륭、측서급서렬분석.결과표명,CDV LP주N단백기인전장1571 bp,예측편마523개안기산;F단백기인전장1989 bp,예측편마662개안기산.F단백안기산서렬중함유5개잠재적N-련당기화위점.취류분석제시,CDV LP주시일주여CDV강독주친원관계흔근적독주.용DNAstar연건대CDV LP주화Onderstepoort약독주N단백화F단백진행료소수성급항원표위예측분석.항원표위차이제시CDV LP독주N화F단백적면역원성가능요우우Onderstepoort약독주.재분자수평상천명료CDV LP주적N화F단백기인경괄합작위구건기인역묘화중조활재체역묘적목적기인.
