中国预防兽医学报
中國預防獸醫學報
중국예방수의학보
CHINESE JOURNAL OF PREVENTIVE VETERINARY MEDICINE
2010年
7期
512-516
,共5页
石文达%刘永刚%王洪峰%王淑杰%马平%徐敏%武佳斌%蔡雪辉
石文達%劉永剛%王洪峰%王淑傑%馬平%徐敏%武佳斌%蔡雪輝
석문체%류영강%왕홍봉%왕숙걸%마평%서민%무가빈%채설휘
猪繁殖与呼吸综合征病毒%全基因组序列分析
豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒%全基因組序列分析
저번식여호흡종합정병독%전기인조서렬분석
为了解猪繁殖与呼吸综合征的弱毒(PRRSV)株在基因组水平上的变异和分子遗传特征,本研究对致弱毒株CH-IR株进行了全基因组序列的测定.结果表明,CH-IR株基因组序列全长15 424 nt,具有典型的动脉炎病毒基因组结构.通过与亲本株CH-1a株序列进行比对,发现其基因组内碱基的缺失和突变主要分布在ORF1a基因的第2191位～2193位、ORF5基因的第439位、ORF6基因的第49位和ORF7基因的第28位和第139位.其中PRRSV CH-IR株的Nsp2蛋白和结构蛋白的变异相对较大,尤其是Nsp2蛋白的变异,同CH-1a株相比,CH-1R株的Nsp2蛋白存在多处核苷酸的突变,其中包括连续3个核苷酸发生缺失;由结构蛋白基因推导的氨基酸序列共有17处变异,在各结构蛋白中以GP3和GP5蛋白变异较大,而高度保守的M蛋白和N蛋白,同样发生了变异,由此预测了Nsp2蛋白的R631E、GP5蛋白的L146Q、M蛋白的Q16L和N蛋白的K46N处毒力相关的氨基酸位点,推测其在毒株致弱过程中起到了重要的作用.
為瞭解豬繁殖與呼吸綜閤徵的弱毒(PRRSV)株在基因組水平上的變異和分子遺傳特徵,本研究對緻弱毒株CH-IR株進行瞭全基因組序列的測定.結果錶明,CH-IR株基因組序列全長15 424 nt,具有典型的動脈炎病毒基因組結構.通過與親本株CH-1a株序列進行比對,髮現其基因組內堿基的缺失和突變主要分佈在ORF1a基因的第2191位～2193位、ORF5基因的第439位、ORF6基因的第49位和ORF7基因的第28位和第139位.其中PRRSV CH-IR株的Nsp2蛋白和結構蛋白的變異相對較大,尤其是Nsp2蛋白的變異,同CH-1a株相比,CH-1R株的Nsp2蛋白存在多處覈苷痠的突變,其中包括連續3箇覈苷痠髮生缺失;由結構蛋白基因推導的氨基痠序列共有17處變異,在各結構蛋白中以GP3和GP5蛋白變異較大,而高度保守的M蛋白和N蛋白,同樣髮生瞭變異,由此預測瞭Nsp2蛋白的R631E、GP5蛋白的L146Q、M蛋白的Q16L和N蛋白的K46N處毒力相關的氨基痠位點,推測其在毒株緻弱過程中起到瞭重要的作用.
위료해저번식여호흡종합정적약독(PRRSV)주재기인조수평상적변이화분자유전특정,본연구대치약독주CH-IR주진행료전기인조서렬적측정.결과표명,CH-IR주기인조서렬전장15 424 nt,구유전형적동맥염병독기인조결구.통과여친본주CH-1a주서렬진행비대,발현기기인조내감기적결실화돌변주요분포재ORF1a기인적제2191위～2193위、ORF5기인적제439위、ORF6기인적제49위화ORF7기인적제28위화제139위.기중PRRSV CH-IR주적Nsp2단백화결구단백적변이상대교대,우기시Nsp2단백적변이,동CH-1a주상비,CH-1R주적Nsp2단백존재다처핵감산적돌변,기중포괄련속3개핵감산발생결실;유결구단백기인추도적안기산서렬공유17처변이,재각결구단백중이GP3화GP5단백변이교대,이고도보수적M단백화N단백,동양발생료변이,유차예측료Nsp2단백적R631E、GP5단백적L146Q、M단백적Q16L화N단백적K46N처독력상관적안기산위점,추측기재독주치약과정중기도료중요적작용.
