检验医学
檢驗醫學
검험의학
LABORATORY MEDICINE
2011年
10期
648-652
,共5页
郑冰%应春妹%汪雅萍%叶杨芹%张灏旻
鄭冰%應春妹%汪雅萍%葉楊芹%張灝旻
정빙%응춘매%왕아평%협양근%장호민
内转录间隔区%基因测序%丝状真菌%形态学鉴定
內轉錄間隔區%基因測序%絲狀真菌%形態學鑒定
내전록간격구%기인측서%사상진균%형태학감정
目的 评价内转录间隔区(ITS)的多态性序列分析(rDNA-ITS序列分析)对临床少见丝状真菌的鉴定作用,以形态学鉴定方法加以补充验证.方法 将3株待检真菌通过聚合酶链反应(PCR)扩增和基因测序方法分析rDNA-ITS序列,从GenBank获取相似序列,使用BLAST工具对rDNA-ITS序列进行对比分析,利用GenBank 中的系统发育软件自动生成系统,构建系统发育树,根据系统发育树并结合对比指标确定距离与同源性均有较大鉴定意义的对比序列,并与真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段的序列分析结果及形态学鉴定结果进行比较.结果 2株菌株能通过rDNA-ITS序列分析的方法鉴定到种,另1株由于相似序列较多,需要形态学方法加以配合鉴定.rDNA -ITS序列分析相对真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段有更好的真菌鉴定作用.结论 相对于传统形态学方法,利用rDNA-ITS序列分析鉴定丝状真菌不受检验人员经验水平影响,较为客观,同时由于其包含的信息量相对丰富,因此,较其他靶序列具有更好的真菌鉴定作用.但该方法也存在一定局限,因此,仍需结合形态学方法进行鉴定.
目的 評價內轉錄間隔區(ITS)的多態性序列分析(rDNA-ITS序列分析)對臨床少見絲狀真菌的鑒定作用,以形態學鑒定方法加以補充驗證.方法 將3株待檢真菌通過聚閤酶鏈反應(PCR)擴增和基因測序方法分析rDNA-ITS序列,從GenBank穫取相似序列,使用BLAST工具對rDNA-ITS序列進行對比分析,利用GenBank 中的繫統髮育軟件自動生成繫統,構建繫統髮育樹,根據繫統髮育樹併結閤對比指標確定距離與同源性均有較大鑒定意義的對比序列,併與真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段的序列分析結果及形態學鑒定結果進行比較.結果 2株菌株能通過rDNA-ITS序列分析的方法鑒定到種,另1株由于相似序列較多,需要形態學方法加以配閤鑒定.rDNA -ITS序列分析相對真菌ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2片段有更好的真菌鑒定作用.結論 相對于傳統形態學方法,利用rDNA-ITS序列分析鑒定絲狀真菌不受檢驗人員經驗水平影響,較為客觀,同時由于其包含的信息量相對豐富,因此,較其他靶序列具有更好的真菌鑒定作用.但該方法也存在一定跼限,因此,仍需結閤形態學方法進行鑒定.
목적 평개내전록간격구(ITS)적다태성서렬분석(rDNA-ITS서렬분석)대림상소견사상진균적감정작용,이형태학감정방법가이보충험증.방법 장3주대검진균통과취합매련반응(PCR)확증화기인측서방법분석rDNA-ITS서렬,종GenBank획취상사서렬,사용BLAST공구대rDNA-ITS서렬진행대비분석,이용GenBank 중적계통발육연건자동생성계통,구건계통발육수,근거계통발육수병결합대비지표학정거리여동원성균유교대감정의의적대비서렬,병여진균ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2편단적서렬분석결과급형태학감정결과진행비교.결과 2주균주능통과rDNA-ITS서렬분석적방법감정도충,령1주유우상사서렬교다,수요형태학방법가이배합감정.rDNA -ITS서렬분석상대진균ITS1、ITS2、26S rDNA D1/D2편단유경호적진균감정작용.결론 상대우전통형태학방법,이용rDNA-ITS서렬분석감정사상진균불수검험인원경험수평영향,교위객관,동시유우기포함적신식량상대봉부,인차,교기타파서렬구유경호적진균감정작용.단해방법야존재일정국한,인차,잉수결합형태학방법진행감정.
