CAJ | 학술논문

沃尔巴克氏体(Wolbachia)主要感染昆虫等节肢动物,是一类革兰阴性共生细菌.为探讨昆虫纲共生菌Wolbachia的系统发育,研究Wolbachia基因组中进化速度较快的外膜蛋白基因wsp的密码子使用模式及影响因素,统计分析该基因的GC含量(GCall、GC1、GC2、GC3、GC3s)、有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)等指标.结果显示:昆虫纲共生菌Wolbachia的wsp基因密码子偏好性均不强,昆虫纲不同目间共生菌Wolbachia的wsp基因碱基组成及ENc值差异较小；多数基因数据点沿标准曲线或在其附近分布,突变对碱基组成的影响较弱；18种由多个密码子编码的氨基酸中有11种氨基酸的偏好性密码子在昆虫纲7个目及对照蛛形纲1个目间均相同,有2种氨基酸的偏好性密码子在7个目间相同,这些密码子均以A/U结尾；供分析的140个wsp基因中仅编码6个半胱氨酸(Cys)；对应分析中第1、第2向量轴贡献率均不高,分别为13.53％和12.49％,均与碱基组成(GC1、GC2、GC3)显著相关.综合各项分析认为,Wolbachia的wsp基因密码子偏好性不具有宿主分类特异性,密码子使用模式主要受碱基组成影响,而碱基组成主要受选择影响.
옥이파극씨체(Wolbachia)주요감염곤충등절지동물,시일류혁란음성공생세균.위탐토곤충강공생균Wolbachia적계통발육,연구Wolbachia기인조중진화속도교쾌적외막단백기인wsp적밀마자사용모식급영향인소,통계분석해기인적GC함량(GCall、GC1、GC2、GC3、GC3s)、유효밀마자수(ENc)、상대동의밀마자사용도(RSCU)등지표.결과현시:곤충강공생균Wolbachia적wsp기인밀마자편호성균불강,곤충강불동목간공생균Wolbachia적wsp기인감기조성급ENc치차이교소；다수기인수거점연표준곡선혹재기부근분포,돌변대감기조성적영향교약；18충유다개밀마자편마적안기산중유11충안기산적편호성밀마자재곤충강7개목급대조주형강1개목간균상동,유2충안기산적편호성밀마자재7개목간상동,저사밀마자균이A/U결미；공분석적140개wsp기인중부편마6개반광안산(Cys)；대응분석중제1、제2향량축공헌솔균불고,분별위13.53％화12.49％,균여감기조성(GC1、GC2、GC3)현저상관.종합각항분석인위,Wolbachia적wsp기인밀마자편호성불구유숙주분류특이성,밀마자사용모식주요수감기조성영향,이감기조성주요수선택영향.