第四军医大学学报
第四軍醫大學學報
제사군의대학학보
JOURNAL OF THE FOURTH MILITARY MEDICAL UNIVERSITY
2003年
20期
1837-1840
,共4页
陈艳炯%邓亚军%叶琳%耿佳宁%李生斌
陳豔炯%鄧亞軍%葉琳%耿佳寧%李生斌
진염형%산아군%협림%경가저%리생빈
猪%胸腺/胚胎学%EST
豬%胸腺/胚胎學%EST
저%흉선/배태학%EST
目的: 构建家猪100 d胚胎胸腺基因表达谱,为研究胸腺的发育和分化机制奠定基础. 方法: 随机挑取家猪100 d胸腺cDNA文库(FTY)的11 712个克隆,进行单向全自动大规模测序,去污染后共获得7071个高质量的表达序列标签(EST)用于基因表达分析. 结果: 对7071个高质量EST的聚类分析结果获得959个多拷贝基因和3074个单拷贝基因. 与非冗余的核酸数据库、Swiss-Prot数据库及人、牛和鼠的Unigene数据库进行BLAST,发现806个多拷贝基因和1669个单拷贝基因(共计5442个ESTs)与已知序列有同源性,1629个EST没有发现同源序列被认为是新基因. 根据功能将已知基因归为7类,其中基因表达相关基因占36.99%,胸腺特异的防御功能相关基因有一定程度表达(占7.55%),这与人婴儿胸腺基因表达谱相类似而不同于成年人胸腺组织. 将109个既发现有ORF又具有PolyA的多拷贝新基因与人类基因组框架序列进行BLAST,发现其中58个有同源序列. 结论: EST技术是发现新基因的有效手段之一;此期家猪胸腺仍处于发育阶段.
目的: 構建傢豬100 d胚胎胸腺基因錶達譜,為研究胸腺的髮育和分化機製奠定基礎. 方法: 隨機挑取傢豬100 d胸腺cDNA文庫(FTY)的11 712箇剋隆,進行單嚮全自動大規模測序,去汙染後共穫得7071箇高質量的錶達序列標籤(EST)用于基因錶達分析. 結果: 對7071箇高質量EST的聚類分析結果穫得959箇多拷貝基因和3074箇單拷貝基因. 與非冗餘的覈痠數據庫、Swiss-Prot數據庫及人、牛和鼠的Unigene數據庫進行BLAST,髮現806箇多拷貝基因和1669箇單拷貝基因(共計5442箇ESTs)與已知序列有同源性,1629箇EST沒有髮現同源序列被認為是新基因. 根據功能將已知基因歸為7類,其中基因錶達相關基因佔36.99%,胸腺特異的防禦功能相關基因有一定程度錶達(佔7.55%),這與人嬰兒胸腺基因錶達譜相類似而不同于成年人胸腺組織. 將109箇既髮現有ORF又具有PolyA的多拷貝新基因與人類基因組框架序列進行BLAST,髮現其中58箇有同源序列. 結論: EST技術是髮現新基因的有效手段之一;此期傢豬胸腺仍處于髮育階段.
목적: 구건가저100 d배태흉선기인표체보,위연구흉선적발육화분화궤제전정기출. 방법: 수궤도취가저100 d흉선cDNA문고(FTY)적11 712개극륭,진행단향전자동대규모측서,거오염후공획득7071개고질량적표체서렬표첨(EST)용우기인표체분석. 결과: 대7071개고질량EST적취류분석결과획득959개다고패기인화3074개단고패기인. 여비용여적핵산수거고、Swiss-Prot수거고급인、우화서적Unigene수거고진행BLAST,발현806개다고패기인화1669개단고패기인(공계5442개ESTs)여이지서렬유동원성,1629개EST몰유발현동원서렬피인위시신기인. 근거공능장이지기인귀위7류,기중기인표체상관기인점36.99%,흉선특이적방어공능상관기인유일정정도표체(점7.55%),저여인영인흉선기인표체보상유사이불동우성년인흉선조직. 장109개기발현유ORF우구유PolyA적다고패신기인여인류기인조광가서렬진행BLAST,발현기중58개유동원서렬. 결론: EST기술시발현신기인적유효수단지일;차기가저흉선잉처우발육계단.
