生物学杂志
生物學雜誌
생물학잡지
JOURNAL OF BIOLOGY
2009年
2期
4-7
,共4页
基因芯片%探针%杂交%信号
基因芯片%探針%雜交%信號
기인심편%탐침%잡교%신호
用表达谱芯片分析阿维链霉菌在发酵过程中转录组表达情况,优化微生物转录组分析条件.提取RNA,进行荧光探针的合成,杂交,扫描对数据进行分析.RNA的提取要注意破壁方法的选择以及菌体量;合成cDNA时,RNA的加入量一般在10μg左右;当cDNA用逆转录的方法得到时,用专门的纯化试剂盒要比传统的异丙醇纯化效果好;杂交温度对于合成基因来说一般在42℃,对于比较长的PCR产物来说,温度相比较要高点;对于杂交时间来说,杂交12h之上,效果要明显比6h的好,所以杂交时间一般选择12h之上.对芯片上的197个合成基因进行分析:大约有60个基因进行了表达,其中包括18个双组分或激酶基因;10个糖酵解或者三羧酸循环途径基因;3个阿维基因簇;7个调节基因;5个细胞分化或孢子形;4个运输或固定基因;两个伴侣分子;5个RNA聚合酶σ因子;3个转录基因;两个脂肪酸合成基因;1个RNA聚合酶β亚基.
用錶達譜芯片分析阿維鏈黴菌在髮酵過程中轉錄組錶達情況,優化微生物轉錄組分析條件.提取RNA,進行熒光探針的閤成,雜交,掃描對數據進行分析.RNA的提取要註意破壁方法的選擇以及菌體量;閤成cDNA時,RNA的加入量一般在10μg左右;噹cDNA用逆轉錄的方法得到時,用專門的純化試劑盒要比傳統的異丙醇純化效果好;雜交溫度對于閤成基因來說一般在42℃,對于比較長的PCR產物來說,溫度相比較要高點;對于雜交時間來說,雜交12h之上,效果要明顯比6h的好,所以雜交時間一般選擇12h之上.對芯片上的197箇閤成基因進行分析:大約有60箇基因進行瞭錶達,其中包括18箇雙組分或激酶基因;10箇糖酵解或者三羧痠循環途徑基因;3箇阿維基因簇;7箇調節基因;5箇細胞分化或孢子形;4箇運輸或固定基因;兩箇伴侶分子;5箇RNA聚閤酶σ因子;3箇轉錄基因;兩箇脂肪痠閤成基因;1箇RNA聚閤酶β亞基.
용표체보심편분석아유련매균재발효과정중전록조표체정황,우화미생물전록조분석조건.제취RNA,진행형광탐침적합성,잡교,소묘대수거진행분석.RNA적제취요주의파벽방법적선택이급균체량;합성cDNA시,RNA적가입량일반재10μg좌우;당cDNA용역전록적방법득도시,용전문적순화시제합요비전통적이병순순화효과호;잡교온도대우합성기인래설일반재42℃,대우비교장적PCR산물래설,온도상비교요고점;대우잡교시간래설,잡교12h지상,효과요명현비6h적호,소이잡교시간일반선택12h지상.대심편상적197개합성기인진행분석:대약유60개기인진행료표체,기중포괄18개쌍조분혹격매기인;10개당효해혹자삼최산순배도경기인;3개아유기인족;7개조절기인;5개세포분화혹포자형;4개운수혹고정기인;량개반려분자;5개RNA취합매σ인자;3개전록기인;량개지방산합성기인;1개RNA취합매β아기.
