CAJ | 학술논문

利用生物信息学分析方法对鸡Lpin1基因编码区进行扫描,选取该基因3个引起错义突变的变异位点进行分析,其中c.391G>A位点引起编码氨基酸Asp131→Asn131突变,c.1727C>T位点引起编码氨基酸Ala576→Val576突变,c.2287A>C位点引起编码氨基酸Met763→Leu763突变.应用引入限制性酶切位点PCR(Amplification-Created Restriction Site PCR,ACRS-PCR)的方法进行引物设计扩增3个突变位点,并通过限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)检测PCR产物,以藏鸡、隐性白羽鸡、藏隐(藏鸡♂×隐性白羽♀)和藏藏隐[藏鸡♂×(藏鸡♂×隐性白羽♀)♀]群体为材料对3个变异位点进行基因型检测,并与胴体性状进行关联分析;同时在5个中国地方鸡种(固始鸡、萧山鸡、北京油鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡)中进行变异位点的遗传多样性分析.结果表明:(1)鸡Lpin1基因c.1727C>T在不同品种中具丰富的多态性;而另2个位点在所检测的群体中无多态性存在,c.391G>A位点以GG基因型为主,c.2287A>C位点全部为AA基因型;(2)对c.1727C>T位点的遗传多样性分析表明该位点C等位基因占优势地位,且固始鸡和北京油鸡群体基因型分布显著偏离哈代-温伯格平衡定律(P<0.01),在萧山鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡三品种中基因型分布均符合哈代-温伯格平衡定律.(3)性状关联分析显示c.1727C>T位点与皮下脂肪厚呈显著关联(P<0.05),与腹脂质量呈极显著关联(P<0.01);其中CC基因型个体的皮下脂肪厚显著高于TT基因型个体(P<0.05),极显著高于TC基因型个体(P<0.01).TT基因型个体的腹脂质量显著高于其他两种基因型个体(P<0.05).
이용생물신식학분석방법대계Lpin1기인편마구진행소묘,선취해기인3개인기착의돌변적변이위점진행분석,기중c.391G>A위점인기편마안기산Asp131→Asn131돌변,c.1727C>T위점인기편마안기산Ala576→Val576돌변,c.2287A>C위점인기편마안기산Met763→Leu763돌변.응용인입한제성매절위점PCR(Amplification-Created Restriction Site PCR,ACRS-PCR)적방법진행인물설계확증3개돌변위점,병통과한제성편단장도다태성(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)검측PCR산물,이장계、은성백우계、장은(장계♂×은성백우♀)화장장은[장계♂×(장계♂×은성백우♀)♀]군체위재료대3개변이위점진행기인형검측,병여동체성상진행관련분석;동시재5개중국지방계충(고시계、소산계、북경유계、태화사우오골계화다화계)중진행변이위점적유전다양성분석.결과표명:(1)계Lpin1기인c.1727C>T재불동품충중구봉부적다태성;이령2개위점재소검측적군체중무다태성존재,c.391G>A위점이GG기인형위주,c.2287A>C위점전부위AA기인형;(2)대c.1727C>T위점적유전다양성분석표명해위점C등위기인점우세지위,차고시계화북경유계군체기인형분포현저편리합대-온백격평형정률(P<0.01),재소산계、태화사우오골계화다화계삼품충중기인형분포균부합합대-온백격평형정률.(3)성상관련분석현시c.1727C>T위점여피하지방후정현저관련(P<0.05),여복지질량정겁현저관련(P<0.01);기중CC기인형개체적피하지방후현저고우TT기인형개체(P<0.05),겁현저고우TC기인형개체(P<0.01).TT기인형개체적복지질량현저고우기타량충기인형개체(P<0.05).