安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
22期
13298-13300,13308
,共4页
张丽英%李祥龙%周荣艳%李兰会%杨清芳
張麗英%李祥龍%週榮豔%李蘭會%楊清芳
장려영%리상룡%주영염%리란회%양청방
Mitf基因%编码区%物种%生物信息学
Mitf基因%編碼區%物種%生物信息學
Mitf기인%편마구%물충%생물신식학
[目的]对不同物种Mitf基因编码区(CDS)进行生物信息学分析.[方法]采用生物信息学方法分析了小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、猕猴、家马、大熊猫、野猪、原鸡和非洲爪蟾Mitf基因编码区的遗传多样性,并对Mitf氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和结构域进行预测和推断.[结果]在12个物种的37条Mitf基因CDS序列中,共检测到466个多态位点,生成16种单倍型,Mitf基因序列编码区在种内及种间存在丰富的遗传多样性;Mitf蛋白理论等电点均低于7,呈酸性,N端无信号肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;蛋白质二级结构的主要元件为α-螺旋和无规则卷曲,有2个保守结构域.[结论]该研究为探明Mitf基因在不同种间和神内的遗传分化,进而为相关黑色素基因的遗传学和进化分析奠定了基础.
[目的]對不同物種Mitf基因編碼區(CDS)進行生物信息學分析.[方法]採用生物信息學方法分析瞭小傢鼠、褐傢鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、獼猴、傢馬、大熊貓、野豬、原鷄和非洲爪蟾Mitf基因編碼區的遺傳多樣性,併對Mitf氨基痠序列、組成成分、導肽、信號肽、跨膜結構域、疏水性/親水性、蛋白質二級結構和結構域進行預測和推斷.[結果]在12箇物種的37條Mitf基因CDS序列中,共檢測到466箇多態位點,生成16種單倍型,Mitf基因序列編碼區在種內及種間存在豐富的遺傳多樣性;Mitf蛋白理論等電點均低于7,呈痠性,N耑無信號肽,無跨膜結構域,肽鏈錶現為親水性;蛋白質二級結構的主要元件為α-螺鏇和無規則捲麯,有2箇保守結構域.[結論]該研究為探明Mitf基因在不同種間和神內的遺傳分化,進而為相關黑色素基因的遺傳學和進化分析奠定瞭基礎.
[목적]대불동물충Mitf기인편마구(CDS)진행생물신식학분석.[방법]채용생물신식학방법분석료소가서、갈가서、인、흑성성、융、모성성、미후、가마、대웅묘、야저、원계화비주조섬Mitf기인편마구적유전다양성,병대Mitf안기산서렬、조성성분、도태、신호태、과막결구역、소수성/친수성、단백질이급결구화결구역진행예측화추단.[결과]재12개물충적37조Mitf기인CDS서렬중,공검측도466개다태위점,생성16충단배형,Mitf기인서렬편마구재충내급충간존재봉부적유전다양성;Mitf단백이론등전점균저우7,정산성,N단무신호태,무과막결구역,태련표현위친수성;단백질이급결구적주요원건위α-라선화무규칙권곡,유2개보수결구역.[결론]해연구위탐명Mitf기인재불동충간화신내적유전분화,진이위상관흑색소기인적유전학화진화분석전정료기출.