生物工程学报
生物工程學報
생물공정학보
CHINESE JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY
2004年
1期
59-62
,共4页
肖洁凝%黄学林%黄霞%李筱菊
肖潔凝%黃學林%黃霞%李篠菊
초길응%황학림%황하%리소국
芒果(Mangifera indica L.)子叶%不定根形成%生长素反应因子基因 (ARF)%cDNA克隆
芒果(Mangifera indica L.)子葉%不定根形成%生長素反應因子基因 (ARF)%cDNA剋隆
망과(Mangifera indica L.)자협%불정근형성%생장소반응인자기인 (ARF)%cDNA극륭
通过SSH法获得了一个与不定根形成相关的差异表达的cDNA片段,其推导的氨基酸序列与拟南芥的生长素反应因子(ARF)类蛋白具有较大的同源性,因此将它命名为MiARF.用所设计的基因特异引物进行3′RACE扩增获得包含完整读码框架(ORF)的MiARF1(GenBank登录号为AY255705)和MiARF2(GenBank登录号为AY300808).MiARF1全长为3272bp,其中,ORF含2523bp,5′非翻译区(5′UTR)含285bp, 3′非翻译区(3′UTR)含464bp.由该序列所推导的氨基酸序列与拟南芥ARF2(BAB10162)的ID值为64%, E值为0,在DNA结合区域(DBD)、III和IV区域的同源性更高,ID值均大于80%. MiARF2 cDNA全长为1474bp,其中ORF含981bp,5′非翻译区含285bp, 3′非翻译区含208bp,由该序列所推导的氨基酸序列与拟南芥ARF2(BAB10162)的ID值为84%,E值为e-151. MiARF2仅具有DBD保守区并与MiARF1的基本相同,但缺乏III和IV区域.Virtural Northern 杂交表明:MiARF2在生根的组织中表达水平高, 而在非生根的组织中未见表达;MiARF1在生根及非生根的组织中均有表达.
通過SSH法穫得瞭一箇與不定根形成相關的差異錶達的cDNA片段,其推導的氨基痠序列與擬南芥的生長素反應因子(ARF)類蛋白具有較大的同源性,因此將它命名為MiARF.用所設計的基因特異引物進行3′RACE擴增穫得包含完整讀碼框架(ORF)的MiARF1(GenBank登錄號為AY255705)和MiARF2(GenBank登錄號為AY300808).MiARF1全長為3272bp,其中,ORF含2523bp,5′非翻譯區(5′UTR)含285bp, 3′非翻譯區(3′UTR)含464bp.由該序列所推導的氨基痠序列與擬南芥ARF2(BAB10162)的ID值為64%, E值為0,在DNA結閤區域(DBD)、III和IV區域的同源性更高,ID值均大于80%. MiARF2 cDNA全長為1474bp,其中ORF含981bp,5′非翻譯區含285bp, 3′非翻譯區含208bp,由該序列所推導的氨基痠序列與擬南芥ARF2(BAB10162)的ID值為84%,E值為e-151. MiARF2僅具有DBD保守區併與MiARF1的基本相同,但缺乏III和IV區域.Virtural Northern 雜交錶明:MiARF2在生根的組織中錶達水平高, 而在非生根的組織中未見錶達;MiARF1在生根及非生根的組織中均有錶達.
통과SSH법획득료일개여불정근형성상관적차이표체적cDNA편단,기추도적안기산서렬여의남개적생장소반응인자(ARF)류단백구유교대적동원성,인차장타명명위MiARF.용소설계적기인특이인물진행3′RACE확증획득포함완정독마광가(ORF)적MiARF1(GenBank등록호위AY255705)화MiARF2(GenBank등록호위AY300808).MiARF1전장위3272bp,기중,ORF함2523bp,5′비번역구(5′UTR)함285bp, 3′비번역구(3′UTR)함464bp.유해서렬소추도적안기산서렬여의남개ARF2(BAB10162)적ID치위64%, E치위0,재DNA결합구역(DBD)、III화IV구역적동원성경고,ID치균대우80%. MiARF2 cDNA전장위1474bp,기중ORF함981bp,5′비번역구함285bp, 3′비번역구함208bp,유해서렬소추도적안기산서렬여의남개ARF2(BAB10162)적ID치위84%,E치위e-151. MiARF2부구유DBD보수구병여MiARF1적기본상동,단결핍III화IV구역.Virtural Northern 잡교표명:MiARF2재생근적조직중표체수평고, 이재비생근적조직중미견표체;MiARF1재생근급비생근적조직중균유표체.
