植物遗传资源学报
植物遺傳資源學報
식물유전자원학보
JOURNAL OF PLANT GENETLC RESOURCES
2011年
5期
686-693
,共8页
王荣升%魏鑫%曹立荣%乔卫华%张万霞%杨庆文
王榮升%魏鑫%曹立榮%喬衛華%張萬霞%楊慶文
왕영승%위흠%조립영%교위화%장만하%양경문
水稻%叶绿体%基因多样性%起源%籼粳分化
水稻%葉綠體%基因多樣性%起源%秈粳分化
수도%협록체%기인다양성%기원%선갱분화
选择原产中国的98份亚洲栽培稻和125份普通野生稻为材料,对叶绿体中atpA序列、rps16内含子序列、trnP-rp133间隔区、trnG-trnfM序列、trnT-trnL间隔区序列的5段高突变序列进行测序,利用生物信息学方法进行比对分析,绘制Network网络图,构建系统发育树.结果表明,普通野生稻的Indel和SNP数目均比亚洲栽培稻多,序列多样性丰富;基于单倍型的Network网络图和系统发育树可将所有参试材料归为3个类群,类群Ⅰ主要为粳稻与普通野生稻,类群Ⅱ主要为籼稻,类群Ⅲ主要为普通野生稻,而类群Ⅱ和类群Ⅲ亲缘关系较近,提示粳、籼两个亚种可能由偏粳、偏籼的普通野生稻分别进化而来,支持二次起源学说;所有与亚洲栽培稻亲缘关系较近的普通野生稻均来源于华南地区,支持华南地区为我国亚洲栽培稻起源中心的论点.
選擇原產中國的98份亞洲栽培稻和125份普通野生稻為材料,對葉綠體中atpA序列、rps16內含子序列、trnP-rp133間隔區、trnG-trnfM序列、trnT-trnL間隔區序列的5段高突變序列進行測序,利用生物信息學方法進行比對分析,繪製Network網絡圖,構建繫統髮育樹.結果錶明,普通野生稻的Indel和SNP數目均比亞洲栽培稻多,序列多樣性豐富;基于單倍型的Network網絡圖和繫統髮育樹可將所有參試材料歸為3箇類群,類群Ⅰ主要為粳稻與普通野生稻,類群Ⅱ主要為秈稻,類群Ⅲ主要為普通野生稻,而類群Ⅱ和類群Ⅲ親緣關繫較近,提示粳、秈兩箇亞種可能由偏粳、偏秈的普通野生稻分彆進化而來,支持二次起源學說;所有與亞洲栽培稻親緣關繫較近的普通野生稻均來源于華南地區,支持華南地區為我國亞洲栽培稻起源中心的論點.
선택원산중국적98빈아주재배도화125빈보통야생도위재료,대협록체중atpA서렬、rps16내함자서렬、trnP-rp133간격구、trnG-trnfM서렬、trnT-trnL간격구서렬적5단고돌변서렬진행측서,이용생물신식학방법진행비대분석,회제Network망락도,구건계통발육수.결과표명,보통야생도적Indel화SNP수목균비아주재배도다,서렬다양성봉부;기우단배형적Network망락도화계통발육수가장소유삼시재료귀위3개류군,류군Ⅰ주요위갱도여보통야생도,류군Ⅱ주요위선도,류군Ⅲ주요위보통야생도,이류군Ⅱ화류군Ⅲ친연관계교근,제시갱、선량개아충가능유편갱、편선적보통야생도분별진화이래,지지이차기원학설;소유여아주재배도친연관계교근적보통야생도균래원우화남지구,지지화남지구위아국아주재배도기원중심적론점.