植物学报
植物學報
식물학보
BULLETIN OF BOTANY
2011年
4期
386-395
,共10页
江媛%范术丽%宋美珍%俞嘉宁%喻树迅
江媛%範術麗%宋美珍%俞嘉寧%喻樹迅
강원%범술려%송미진%유가저%유수신
叶绿体%顺式作用元件%棉花%RNA编辑
葉綠體%順式作用元件%棉花%RNA編輯
협록체%순식작용원건%면화%RNA편집
陆生植物叶绿体RNA编辑是转录后基因表达调控的一种重要方式.该文在预测棉花(Gossypium hirsutum)叶绿体基因RNA编辑位点的基础上,选取中棉10 (CRRI 10)为实验材料,采用PCR、RT-PCR及测序等方法,确定CRRI 10的27个叶绿体蛋白编码基因共有55个编辑位点,均是C→U的转换.与棉种柯字310(C310)的编辑位点比对后发现,CRRI 10多出accD-468和rpoC1-163两个编辑位点,同时缺失psbN-10.利用生物信息学分析这3个位点,rpoC1-163和psbN-10的编辑可能会改变各自蛋白的二级结构.对CRRI10中55个编辑位点上游的顺式作用元件(-30--1)分析显示,共有8组顺式作用元件的相似性达到60％或以上,推测各组中的编辑位点可能由相同的反式作用因子来识别.
陸生植物葉綠體RNA編輯是轉錄後基因錶達調控的一種重要方式.該文在預測棉花(Gossypium hirsutum)葉綠體基因RNA編輯位點的基礎上,選取中棉10 (CRRI 10)為實驗材料,採用PCR、RT-PCR及測序等方法,確定CRRI 10的27箇葉綠體蛋白編碼基因共有55箇編輯位點,均是C→U的轉換.與棉種柯字310(C310)的編輯位點比對後髮現,CRRI 10多齣accD-468和rpoC1-163兩箇編輯位點,同時缺失psbN-10.利用生物信息學分析這3箇位點,rpoC1-163和psbN-10的編輯可能會改變各自蛋白的二級結構.對CRRI10中55箇編輯位點上遊的順式作用元件(-30--1)分析顯示,共有8組順式作用元件的相似性達到60％或以上,推測各組中的編輯位點可能由相同的反式作用因子來識彆.
륙생식물협록체RNA편집시전록후기인표체조공적일충중요방식.해문재예측면화(Gossypium hirsutum)협록체기인RNA편집위점적기출상,선취중면10 (CRRI 10)위실험재료,채용PCR、RT-PCR급측서등방법,학정CRRI 10적27개협록체단백편마기인공유55개편집위점,균시C→U적전환.여면충가자310(C310)적편집위점비대후발현,CRRI 10다출accD-468화rpoC1-163량개편집위점,동시결실psbN-10.이용생물신식학분석저3개위점,rpoC1-163화psbN-10적편집가능회개변각자단백적이급결구.대CRRI10중55개편집위점상유적순식작용원건(-30--1)분석현시,공유8조순식작용원건적상사성체도60％혹이상,추측각조중적편집위점가능유상동적반식작용인자래식별.
