CAJ | 학술논문

通过分段设计引物,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)LX、JX株基因组进行RT-PCR扩增,对各片段cDNA进行克隆和序列测定,拼接后获得全基因组序列.结果,PRRSV LX株全基因组序列长度为15 412 bp(不包括PolyA尾),PRRSV JX株全基因组序列长度为15 320 bp(不包括PolyA尾).序列分析表明,JX株全基因组核苷酸序列与LX株、JXA1、VR2332、CH-1a、BJ-4、LV同源性分别为91.1%、98.6%、91.0%、94.6%、90.9%、61.7%;LX株全基因组核苷酸序列与JX株、JXA1、VR2332、CH-1a、BJ-4、LV同源性分别为91.1%、89.7%、99.7%、91.5%、99.7%、62.2%.对不同分离株的5′-UTR、Nsp2进行了序列比较,并根据5′-UTR、Nsp2、ORF5的基因序列和氨基酸序列,对国内外分离株进行了系统进化分析.根据5′-UTR核苷酸序列,可将PRRSV美洲型毒株分为4个亚群,Lx株和Jx株分别属于经典美洲型和"高热病"变异型.根据Nsp2氨基酸序列分析了不同分离株的分子进化关系.表明依据Nsp2序列美洲型分离株可初步划分为5个亚群,JX株独立于其他毒株,独自处于一个分支.依据ORF5序列也可将美洲型分离株划分为5个亚群.本研究为探讨PRRSV的分子进化莫定了基础.
통과분단설계인물,대저번식여호흡종합정병독(PRRSV)LX、JX주기인조진행RT-PCR확증,대각편단cDNA진행극륭화서렬측정,병접후획득전기인조서렬.결과,PRRSV LX주전기인조서렬장도위15 412 bp(불포괄PolyA미),PRRSV JX주전기인조서렬장도위15 320 bp(불포괄PolyA미).서렬분석표명,JX주전기인조핵감산서렬여LX주、JXA1、VR2332、CH-1a、BJ-4、LV동원성분별위91.1%、98.6%、91.0%、94.6%、90.9%、61.7%;LX주전기인조핵감산서렬여JX주、JXA1、VR2332、CH-1a、BJ-4、LV동원성분별위91.1%、89.7%、99.7%、91.5%、99.7%、62.2%.대불동분리주적5′-UTR、Nsp2진행료서렬비교,병근거5′-UTR、Nsp2、ORF5적기인서렬화안기산서렬,대국내외분리주진행료계통진화분석.근거5′-UTR핵감산서렬,가장PRRSV미주형독주분위4개아군,Lx주화Jx주분별속우경전미주형화"고열병"변이형.근거Nsp2안기산서렬분석료불동분리주적분자진화관계.표명의거Nsp2서렬미주형분리주가초보화분위5개아군,JX주독립우기타독주,독자처우일개분지.의거ORF5서렬야가장미주형분리주화분위5개아군.본연구위탐토PRRSV적분자진화막정료기출.