生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2003年
6期
919-922
,共4页
HPCL2%基因结构%选择性剪切%外显子遗漏
HPCL2%基因結構%選擇性剪切%外顯子遺漏
HPCL2%기인결구%선택성전절%외현자유루
2-羟基植烷酸辅酶A裂解酶(2-hydroxypanthyl-CoA lyase,HPCL2)是3-甲基脂肪酸α-氧化途径中的关键酶.采用鸟枪法测序技术,得到了HPCL2基因的基因组序列.结果显示,HPCL2基因组大小为40 829 bp,共有17个外显子,16个内含子.外显子平均大小为116 bp,内含子平均大小为2 429 bp,属于结构紧凑基因.从dbEST数据库中筛选与HPCL2基因的mRNA (GenBank Acc.:AJ131753) 相互重叠表达序列标签(EST)共有213个,分别来自29个不同的组织.将EST与基因组序列进行Blast分析,共检测17个EST具有选择性剪切,其中14例属外显子遗漏(exon skipping),2例外显子增加 (exon inclusion)和1例剪切位点改变(splicing site shift).外显子遗漏主要发生在5′端的第3到第8个外显子.结果表明,外显子遗漏可能是HPCL2基因选择性剪切的主要形式.
2-羥基植烷痠輔酶A裂解酶(2-hydroxypanthyl-CoA lyase,HPCL2)是3-甲基脂肪痠α-氧化途徑中的關鍵酶.採用鳥鎗法測序技術,得到瞭HPCL2基因的基因組序列.結果顯示,HPCL2基因組大小為40 829 bp,共有17箇外顯子,16箇內含子.外顯子平均大小為116 bp,內含子平均大小為2 429 bp,屬于結構緊湊基因.從dbEST數據庫中篩選與HPCL2基因的mRNA (GenBank Acc.:AJ131753) 相互重疊錶達序列標籤(EST)共有213箇,分彆來自29箇不同的組織.將EST與基因組序列進行Blast分析,共檢測17箇EST具有選擇性剪切,其中14例屬外顯子遺漏(exon skipping),2例外顯子增加 (exon inclusion)和1例剪切位點改變(splicing site shift).外顯子遺漏主要髮生在5′耑的第3到第8箇外顯子.結果錶明,外顯子遺漏可能是HPCL2基因選擇性剪切的主要形式.
2-간기식완산보매A렬해매(2-hydroxypanthyl-CoA lyase,HPCL2)시3-갑기지방산α-양화도경중적관건매.채용조창법측서기술,득도료HPCL2기인적기인조서렬.결과현시,HPCL2기인조대소위40 829 bp,공유17개외현자,16개내함자.외현자평균대소위116 bp,내함자평균대소위2 429 bp,속우결구긴주기인.종dbEST수거고중사선여HPCL2기인적mRNA (GenBank Acc.:AJ131753) 상호중첩표체서렬표첨(EST)공유213개,분별래자29개불동적조직.장EST여기인조서렬진행Blast분석,공검측17개EST구유선택성전절,기중14례속외현자유루(exon skipping),2예외현자증가 (exon inclusion)화1례전절위점개변(splicing site shift).외현자유루주요발생재5′단적제3도제8개외현자.결과표명,외현자유루가능시HPCL2기인선택성전절적주요형식.
