浙江大学学报(理学版)
浙江大學學報(理學版)
절강대학학보(이학판)
JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY
2010年
6期
691-699
,共9页
史铁伟%李勇%韩冰%康虹丽%LU Ping
史鐵偉%李勇%韓冰%康虹麗%LU Ping
사철위%리용%한빙%강홍려%LU Ping
扁穗冰草%磷脂酶D%克隆%生物信息学%RACE
扁穗冰草%燐脂酶D%剋隆%生物信息學%RACE
편수빙초%린지매D%극륭%생물신식학%RACE
利用RT PCR技术和RACE方法克隆得到扁穗冰草(Agropyron cristatum(L.) Gaertn)PLD基因cDNA的全长,并对该cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、二级结构、三级结构、无序化特性进行了预测和分析.结果显示:扁穗冰草PLD基因具有2967个核苷酸,含有PLD所特有的HKD基序和C2结构域,属亲水性蛋白,二级结构以无规卷曲为主,蛋白质的三级结构显示两个HKD基序靠近形成具功能的活性位点,蛋白质无序化分析发现无序化区域较少;进化树分析表明与蒙古冰草亲缘关系最近,与草莓亲缘关系最远.为研究扁穗冰草PLD在干旱胁迫信号转导及应答过程的机理奠定基础.
利用RT PCR技術和RACE方法剋隆得到扁穗冰草(Agropyron cristatum(L.) Gaertn)PLD基因cDNA的全長,併對該cDNA序列、氨基痠序列的相似性、組成成分、理化性質、疏水性/親水性、進化樹、二級結構、三級結構、無序化特性進行瞭預測和分析.結果顯示:扁穗冰草PLD基因具有2967箇覈苷痠,含有PLD所特有的HKD基序和C2結構域,屬親水性蛋白,二級結構以無規捲麯為主,蛋白質的三級結構顯示兩箇HKD基序靠近形成具功能的活性位點,蛋白質無序化分析髮現無序化區域較少;進化樹分析錶明與矇古冰草親緣關繫最近,與草莓親緣關繫最遠.為研究扁穗冰草PLD在榦旱脅迫信號轉導及應答過程的機理奠定基礎.
이용RT PCR기술화RACE방법극륭득도편수빙초(Agropyron cristatum(L.) Gaertn)PLD기인cDNA적전장,병대해cDNA서렬、안기산서렬적상사성、조성성분、이화성질、소수성/친수성、진화수、이급결구、삼급결구、무서화특성진행료예측화분석.결과현시:편수빙초PLD기인구유2967개핵감산,함유PLD소특유적HKD기서화C2결구역,속친수성단백,이급결구이무규권곡위주,단백질적삼급결구현시량개HKD기서고근형성구공능적활성위점,단백질무서화분석발현무서화구역교소;진화수분석표명여몽고빙초친연관계최근,여초매친연관계최원.위연구편수빙초PLD재간한협박신호전도급응답과정적궤리전정기출.
