中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
17期
160-164
,共5页
郭昱嵩%谢子强%邓岳文%刘楚吾
郭昱嵩%謝子彊%鄧嶽文%劉楚吾
곽욱숭%사자강%산악문%류초오
波纹巴非蛤%微卫星DNA%磁珠富集%遗传多样性
波紋巴非蛤%微衛星DNA%磁珠富集%遺傳多樣性
파문파비합%미위성DNA%자주부집%유전다양성
为揭示波纹巴非蛤种质遗传特性、开发种质库,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了其基因组微卫星标记的分离与筛选研究.基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15或(AAG)7探针与其杂交,然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增后形成双链,最后进行克隆转化,构建微卫星富集文库.挑选克隆用探针引物(CA)15或(AAG)7和载体引物进行PCR筛选,测序得到含有微卫星DNA的序列,根据序列设计和合成微卫星引物,进行引物适用性分析,并分析了湛江群体的遗传结构.结果表明:8对微卫星引物在湛江群体共检测到108个等位基因,每个位点等位基因数为5~19,期望杂合度为0.666~0.926,观测杂合度为0.400~0.882,4个位点(Pur4,Pun5,Pun6,Pun7)显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.00625);PIC介于0.62~0.92,所有位点均属于高度多态位点(PIC>0.5).说明FIASCO技术适合于波纹巴非蛤微卫星标记的分离与筛选,筛选得到的8个微卫星位点能用于波纹巴非蛤遗传多样性分析及野生群体与养殖群体的群体结构分析.
為揭示波紋巴非蛤種質遺傳特性、開髮種質庫,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技術開展瞭其基因組微衛星標記的分離與篩選研究.基因組DNA經限製性內切酶MseI酶切後與接頭連接,用生物素標記的(CA)15或(AAG)7探針與其雜交,然後用磁珠富集、洗脫穫得單鏈目的片段,經PCR擴增後形成雙鏈,最後進行剋隆轉化,構建微衛星富集文庫.挑選剋隆用探針引物(CA)15或(AAG)7和載體引物進行PCR篩選,測序得到含有微衛星DNA的序列,根據序列設計和閤成微衛星引物,進行引物適用性分析,併分析瞭湛江群體的遺傳結構.結果錶明:8對微衛星引物在湛江群體共檢測到108箇等位基因,每箇位點等位基因數為5~19,期望雜閤度為0.666~0.926,觀測雜閤度為0.400~0.882,4箇位點(Pur4,Pun5,Pun6,Pun7)顯著偏離哈迪-溫伯格平衡(P<0.00625);PIC介于0.62~0.92,所有位點均屬于高度多態位點(PIC>0.5).說明FIASCO技術適閤于波紋巴非蛤微衛星標記的分離與篩選,篩選得到的8箇微衛星位點能用于波紋巴非蛤遺傳多樣性分析及野生群體與養殖群體的群體結構分析.
위게시파문파비합충질유전특성、개발충질고,이용FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)기술개전료기기인조미위성표기적분리여사선연구.기인조DNA경한제성내절매MseI매절후여접두련접,용생물소표기적(CA)15혹(AAG)7탐침여기잡교,연후용자주부집、세탈획득단련목적편단,경PCR확증후형성쌍련,최후진행극륭전화,구건미위성부집문고.도선극륭용탐침인물(CA)15혹(AAG)7화재체인물진행PCR사선,측서득도함유미위성DNA적서렬,근거서렬설계화합성미위성인물,진행인물괄용성분석,병분석료담강군체적유전결구.결과표명:8대미위성인물재담강군체공검측도108개등위기인,매개위점등위기인수위5~19,기망잡합도위0.666~0.926,관측잡합도위0.400~0.882,4개위점(Pur4,Pun5,Pun6,Pun7)현저편리합적-온백격평형(P<0.00625);PIC개우0.62~0.92,소유위점균속우고도다태위점(PIC>0.5).설명FIASCO기술괄합우파문파비합미위성표기적분리여사선,사선득도적8개미위성위점능용우파문파비합유전다양성분석급야생군체여양식군체적군체결구분석.