基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
3期
296-302
,共7页
草鱼%cyclin G1%进化
草魚%cyclin G1%進化
초어%cyclin G1%진화
本研究从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝肾cDNA文库中克隆到草鱼cyclin G1基因.测序结果表明,草鱼cyclin G1全长cDNA为2 118 bp,使用ORF finder推译其开放阅读框为第256 bp～第1 155 bp,编码299个aa,SMART在线软件预测其中N端第57个aa～第143个aa为细胞周期蛋白盒.同源性比对分析显示cyclin G1在鱼类中同源性极高,其中草鱼cyclin G1与斑马鱼的同源性为90%.通过PAML软件的密码子替换模型进行适应性进化分析,结果表明cyclin G1编码蛋白的26A、171A和225K氨基酸位点受到正选择作用.本研究为进一步了解草鱼cyclin G1结构功能与分子演化打下基础.
本研究從草魚(Ctenopharyngodon idellus)肝腎cDNA文庫中剋隆到草魚cyclin G1基因.測序結果錶明,草魚cyclin G1全長cDNA為2 118 bp,使用ORF finder推譯其開放閱讀框為第256 bp～第1 155 bp,編碼299箇aa,SMART在線軟件預測其中N耑第57箇aa～第143箇aa為細胞週期蛋白盒.同源性比對分析顯示cyclin G1在魚類中同源性極高,其中草魚cyclin G1與斑馬魚的同源性為90%.通過PAML軟件的密碼子替換模型進行適應性進化分析,結果錶明cyclin G1編碼蛋白的26A、171A和225K氨基痠位點受到正選擇作用.本研究為進一步瞭解草魚cyclin G1結構功能與分子縯化打下基礎.
본연구종초어(Ctenopharyngodon idellus)간신cDNA문고중극륭도초어cyclin G1기인.측서결과표명,초어cyclin G1전장cDNA위2 118 bp,사용ORF finder추역기개방열독광위제256 bp～제1 155 bp,편마299개aa,SMART재선연건예측기중N단제57개aa～제143개aa위세포주기단백합.동원성비대분석현시cyclin G1재어류중동원성겁고,기중초어cyclin G1여반마어적동원성위90%.통과PAML연건적밀마자체환모형진행괄응성진화분석,결과표명cyclin G1편마단백적26A、171A화225K안기산위점수도정선택작용.본연구위진일보료해초어cyclin G1결구공능여분자연화타하기출.
