吉林农业科学
吉林農業科學
길임농업과학
JOURNAL OF JILIN AGRICULTURAL SCIENCES
2008年
6期
25-29
,共5页
麻鹏达%周磊%李毅丹%谭化%刘艳芝
痳鵬達%週磊%李毅丹%譚化%劉豔芝
마붕체%주뢰%리의단%담화%류염지
大肠杆菌Top10%Na+/H+反向运输体基因%基因克隆%生物信息学分析
大腸桿菌Top10%Na+/H+反嚮運輸體基因%基因剋隆%生物信息學分析
대장간균Top10%Na+/H+반향운수체기인%기인극륭%생물신식학분석
根据细菌中存在的Na+/H+反向运输体(Na+/H+antiporterA,nhaA)的基因序列,采用PCR扩增的方法从大肠杆菌(Eseherichia coli)Top10中克隆到了nhaA基因(Acession Numeber:EU368045).nhaA开放阅读框为1 167 bp,编码含有388个氨基酸残基,分子量为41.3 kDa的蛋白,预测等电点为9.23.nhaA含有25个碱性氨基酸,19个酸性氨基酸,211个疏水氨基酸及63个极性氨基酸.二级结构预测表明,该蛋白含约50%的α-螺旋、18%的延伸链、7%的β-转角和25%的不规则卷曲.亲疏水性分析显示,nhaA是疏水性蛋白.跨膜结构进行分析显示该蛋白含有11个跨膜区域.序列分析表明,大肠杆菌Top10 nhaA基因与大肠杆菌DH5α、大肠杆菌HS、大肠杆菌SECEC SMS-3-5和大肠杆菌CFT073的nhaA基因同源性分别为100%、98%、95%和92%.大肠杆菌Top10 nhaA基因的克隆及生物信息学分析为今后对nhaA的进一步深入研究奠定了基础.
根據細菌中存在的Na+/H+反嚮運輸體(Na+/H+antiporterA,nhaA)的基因序列,採用PCR擴增的方法從大腸桿菌(Eseherichia coli)Top10中剋隆到瞭nhaA基因(Acession Numeber:EU368045).nhaA開放閱讀框為1 167 bp,編碼含有388箇氨基痠殘基,分子量為41.3 kDa的蛋白,預測等電點為9.23.nhaA含有25箇堿性氨基痠,19箇痠性氨基痠,211箇疏水氨基痠及63箇極性氨基痠.二級結構預測錶明,該蛋白含約50%的α-螺鏇、18%的延伸鏈、7%的β-轉角和25%的不規則捲麯.親疏水性分析顯示,nhaA是疏水性蛋白.跨膜結構進行分析顯示該蛋白含有11箇跨膜區域.序列分析錶明,大腸桿菌Top10 nhaA基因與大腸桿菌DH5α、大腸桿菌HS、大腸桿菌SECEC SMS-3-5和大腸桿菌CFT073的nhaA基因同源性分彆為100%、98%、95%和92%.大腸桿菌Top10 nhaA基因的剋隆及生物信息學分析為今後對nhaA的進一步深入研究奠定瞭基礎.
근거세균중존재적Na+/H+반향운수체(Na+/H+antiporterA,nhaA)적기인서렬,채용PCR확증적방법종대장간균(Eseherichia coli)Top10중극륭도료nhaA기인(Acession Numeber:EU368045).nhaA개방열독광위1 167 bp,편마함유388개안기산잔기,분자량위41.3 kDa적단백,예측등전점위9.23.nhaA함유25개감성안기산,19개산성안기산,211개소수안기산급63개겁성안기산.이급결구예측표명,해단백함약50%적α-라선、18%적연신련、7%적β-전각화25%적불규칙권곡.친소수성분석현시,nhaA시소수성단백.과막결구진행분석현시해단백함유11개과막구역.서렬분석표명,대장간균Top10 nhaA기인여대장간균DH5α、대장간균HS、대장간균SECEC SMS-3-5화대장간균CFT073적nhaA기인동원성분별위100%、98%、95%화92%.대장간균Top10 nhaA기인적극륭급생물신식학분석위금후대nhaA적진일보심입연구전정료기출.
