微生物学通报
微生物學通報
미생물학통보
MICROBIOLOGY
2008年
11期
1715-1720
,共6页
李友发%宋兵%宋亚娜%郑斯平%翟焕趁%郑伟文
李友髮%宋兵%宋亞娜%鄭斯平%翟煥趁%鄭偉文
리우발%송병%송아나%정사평%적환진%정위문
稻田土壤%细菌群落%16S%rDNA-PCR-DGGE
稻田土壤%細菌群落%16S%rDNA-PCR-DGGE
도전토양%세균군락%16S%rDNA-PCR-DGGE
用不依赖细菌培养的16S rDNA-PCR-DGGE方法对福建省6个不同地区12个取样点的稻田土壤进行细菌群落结构分析.对12份样品直接提取其总DNA,用F341GC/R534引物扩增16SrDNA基因的V3可变区,结合DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术分析样品细菌群落组成.结果表明,福建省不同地区的稻田土壤之间细菌群落结构存在较大差异.犬体上可分为闽东、闽南、闽北、闽西4个大类.同一地区的根际土和表土样品之间也存在差异,但差异相对较低,其中龙岩根际土和表土细菌群落结构相似性最大,永泰差异性最大.回收了DGGE图谱中11个条带,测序结果经过Blast比对表明其中10个条带代表的细菌是不可培养的,显示了DGGE技术的优越性.
用不依賴細菌培養的16S rDNA-PCR-DGGE方法對福建省6箇不同地區12箇取樣點的稻田土壤進行細菌群落結構分析.對12份樣品直接提取其總DNA,用F341GC/R534引物擴增16SrDNA基因的V3可變區,結閤DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技術分析樣品細菌群落組成.結果錶明,福建省不同地區的稻田土壤之間細菌群落結構存在較大差異.犬體上可分為閩東、閩南、閩北、閩西4箇大類.同一地區的根際土和錶土樣品之間也存在差異,但差異相對較低,其中龍巖根際土和錶土細菌群落結構相似性最大,永泰差異性最大.迴收瞭DGGE圖譜中11箇條帶,測序結果經過Blast比對錶明其中10箇條帶代錶的細菌是不可培養的,顯示瞭DGGE技術的優越性.
용불의뢰세균배양적16S rDNA-PCR-DGGE방법대복건성6개불동지구12개취양점적도전토양진행세균군락결구분석.대12빈양품직접제취기총DNA,용F341GC/R534인물확증16SrDNA기인적V3가변구,결합DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)기술분석양품세균군락조성.결과표명,복건성불동지구적도전토양지간세균군락결구존재교대차이.견체상가분위민동、민남、민북、민서4개대류.동일지구적근제토화표토양품지간야존재차이,단차이상대교저,기중룡암근제토화표토세균군락결구상사성최대,영태차이성최대.회수료DGGE도보중11개조대,측서결과경과Blast비대표명기중10개조대대표적세균시불가배양적,현시료DGGE기술적우월성.