广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2007年
9期
54-58
,共5页
卢雅薇%沈文涛%唐清杰%牛艳梅%周鹏
盧雅薇%瀋文濤%唐清傑%牛豔梅%週鵬
로아미%침문도%당청걸%우염매%주붕
番木瓜环斑病毒%全基因组%同源性%系统进化树
番木瓜環斑病毒%全基因組%同源性%繫統進化樹
번목과배반병독%전기인조%동원성%계통진화수
从感病的海南番木瓜叶片中提取总RNA,经RT-PCR和RACE方法分段扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)全基因组序列.序列拼接结果显示,PRSV中国海南分离株(HaiNan-P)基因组除3'-末端polyA尾巴外,由10323个核苷酸组成,编码3343个氨基酸.同源性分析表明,HaiNan-P编码的氨基酸序列与GenBank中公布的11株PRSV同源性为89.8%～93.2%,略高于全长核苷酸的82.3%～89.1%.P1蛋白编码区同源性较低,仅为65.4%～80.1%,而HC-Pro、CI及CP同源性相对较高.运用MEGA 3.1软件、NJ法绘制系统进化树,分析结果显示,PRSV分离株类群分化与地理分布有一定的相关性.
從感病的海南番木瓜葉片中提取總RNA,經RT-PCR和RACE方法分段擴增番木瓜環斑病毒(PRSV)全基因組序列.序列拼接結果顯示,PRSV中國海南分離株(HaiNan-P)基因組除3'-末耑polyA尾巴外,由10323箇覈苷痠組成,編碼3343箇氨基痠.同源性分析錶明,HaiNan-P編碼的氨基痠序列與GenBank中公佈的11株PRSV同源性為89.8%～93.2%,略高于全長覈苷痠的82.3%～89.1%.P1蛋白編碼區同源性較低,僅為65.4%～80.1%,而HC-Pro、CI及CP同源性相對較高.運用MEGA 3.1軟件、NJ法繪製繫統進化樹,分析結果顯示,PRSV分離株類群分化與地理分佈有一定的相關性.
종감병적해남번목과협편중제취총RNA,경RT-PCR화RACE방법분단확증번목과배반병독(PRSV)전기인조서렬.서렬병접결과현시,PRSV중국해남분리주(HaiNan-P)기인조제3'-말단polyA미파외,유10323개핵감산조성,편마3343개안기산.동원성분석표명,HaiNan-P편마적안기산서렬여GenBank중공포적11주PRSV동원성위89.8%～93.2%,략고우전장핵감산적82.3%～89.1%.P1단백편마구동원성교저,부위65.4%～80.1%,이HC-Pro、CI급CP동원성상대교고.운용MEGA 3.1연건、NJ법회제계통진화수,분석결과현시,PRSV분리주류군분화여지리분포유일정적상관성.
