微生物学通报
微生物學通報
미생물학통보
MICROBIOLOGY
2002年
6期
28-32
,共5页
ERIC序列,EBIC-PCR,E.coli K-12 MG1655菌株
ERIC序列,EBIC-PCR,E.coli K-12 MG1655菌株
ERIC서렬,EBIC-PCR,E.coli K-12 MG1655균주
ERIC-PCR已经在细菌分类、鉴定及混合菌群分析中得到广泛应用,但对其产物形成规律的认识仍存在分歧.以大肠杆菌MG1655为对象,对其EBIC-PCR指纹图谱中1.1kb主带中的DNA片段进行了克隆、测序、基因组定位以及引物匹配分析.结果表明,这条1.1kb主带由分布在基因组中不同位置的3种序列不同的片段组成,各片段的丰度差异较大,最高为97.89%;3种片段中的2种所在的基因组区域仅一端含有ERIC序列.推测对含有ERIC序列的基因组DNA进行扩增时,ERIC-PCR是一种非随机扩增.
ERIC-PCR已經在細菌分類、鑒定及混閤菌群分析中得到廣汎應用,但對其產物形成規律的認識仍存在分歧.以大腸桿菌MG1655為對象,對其EBIC-PCR指紋圖譜中1.1kb主帶中的DNA片段進行瞭剋隆、測序、基因組定位以及引物匹配分析.結果錶明,這條1.1kb主帶由分佈在基因組中不同位置的3種序列不同的片段組成,各片段的豐度差異較大,最高為97.89%;3種片段中的2種所在的基因組區域僅一耑含有ERIC序列.推測對含有ERIC序列的基因組DNA進行擴增時,ERIC-PCR是一種非隨機擴增.
ERIC-PCR이경재세균분류、감정급혼합균군분석중득도엄범응용,단대기산물형성규률적인식잉존재분기.이대장간균MG1655위대상,대기EBIC-PCR지문도보중1.1kb주대중적DNA편단진행료극륭、측서、기인조정위이급인물필배분석.결과표명,저조1.1kb주대유분포재기인조중불동위치적3충서렬불동적편단조성,각편단적봉도차이교대,최고위97.89%;3충편단중적2충소재적기인조구역부일단함유ERIC서렬.추측대함유ERIC서렬적기인조DNA진행확증시,ERIC-PCR시일충비수궤확증.
