复旦学报(医学版)
複旦學報(醫學版)
복단학보(의학판)
JOURNAL OF FUDAN UNIVERSITY
2003年
1期
68-70
,共3页
肖家全%谭建明%李成涛%李瑶%沈瑾%康敏华%方燕红
肖傢全%譚建明%李成濤%李瑤%瀋瑾%康敏華%方燕紅
초가전%담건명%리성도%리요%침근%강민화%방연홍
人类白细胞抗原-DRB1%基因芯片%顺序特异引物聚合酶链反应%基因分型
人類白細胞抗原-DRB1%基因芯片%順序特異引物聚閤酶鏈反應%基因分型
인류백세포항원-DRB1%기인심편%순서특이인물취합매련반응%기인분형
目的比较基因芯片和PCR-SSP用于汉族南方人群HLA-DRB1基因分型的结果,评价分型芯片的准确性.方法 77份待分型样本,分别用等位基因特异的PCR-SSP和基因分型芯片对DRB1分型.芯片分型通过组间特异引物扩增基因组DNA,扩增中用荧光标记.扩增标记后的产物与分型芯片的探针杂交,通过杂交产生的荧光信号确定样品的HLA-DRB1基因亚型,比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本全部经第三方验证或测序.结果 77份样本,两种方法分型全部成功.分型结果的吻合率为93%.不吻合样本6份,其中SSP定型纯合子4份,芯片分型全部为杂合子.经第三方验证,证实芯片对纯合子和杂合子的分型全部正确.另外2份不吻合的样本经测序,证实SSP分型错误1份,芯片分型错误1份.芯片的重复率为96%.结论基因芯片是一种理想的分型方法,具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、一次可作多份样本的优点.
目的比較基因芯片和PCR-SSP用于漢族南方人群HLA-DRB1基因分型的結果,評價分型芯片的準確性.方法 77份待分型樣本,分彆用等位基因特異的PCR-SSP和基因分型芯片對DRB1分型.芯片分型通過組間特異引物擴增基因組DNA,擴增中用熒光標記.擴增標記後的產物與分型芯片的探針雜交,通過雜交產生的熒光信號確定樣品的HLA-DRB1基因亞型,比較兩種方法分型所穫得的結果,不吻閤的樣本全部經第三方驗證或測序.結果 77份樣本,兩種方法分型全部成功.分型結果的吻閤率為93%.不吻閤樣本6份,其中SSP定型純閤子4份,芯片分型全部為雜閤子.經第三方驗證,證實芯片對純閤子和雜閤子的分型全部正確.另外2份不吻閤的樣本經測序,證實SSP分型錯誤1份,芯片分型錯誤1份.芯片的重複率為96%.結論基因芯片是一種理想的分型方法,具有特異性高、重複性好、操作簡便、所需樣本量少、一次可作多份樣本的優點.
목적비교기인심편화PCR-SSP용우한족남방인군HLA-DRB1기인분형적결과,평개분형심편적준학성.방법 77빈대분형양본,분별용등위기인특이적PCR-SSP화기인분형심편대DRB1분형.심편분형통과조간특이인물확증기인조DNA,확증중용형광표기.확증표기후적산물여분형심편적탐침잡교,통과잡교산생적형광신호학정양품적HLA-DRB1기인아형,비교량충방법분형소획득적결과,불문합적양본전부경제삼방험증혹측서.결과 77빈양본,량충방법분형전부성공.분형결과적문합솔위93%.불문합양본6빈,기중SSP정형순합자4빈,심편분형전부위잡합자.경제삼방험증,증실심편대순합자화잡합자적분형전부정학.령외2빈불문합적양본경측서,증실SSP분형착오1빈,심편분형착오1빈.심편적중복솔위96%.결론기인심편시일충이상적분형방법,구유특이성고、중복성호、조작간편、소수양본량소、일차가작다빈양본적우점.
