中山大学学报(自然科学版)
中山大學學報(自然科學版)
중산대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2004年
5期
80-82
,共3页
寸树健%邓百煌%邓日强%杨彦臻%吴文言
吋樹健%鄧百煌%鄧日彊%楊彥臻%吳文言
촌수건%산백황%산일강%양언진%오문언
linux%blast%emboss%phylib%生物信息学工作站
linux%blast%emboss%phylib%生物信息學工作站
linux%blast%emboss%phylib%생물신식학공작참
介绍利用常见的x86 PC,Linux操作系统配合BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常见的生物分析软件构建可以完成多种蛋白数据分析的大规模自动分析系统.该系统可自动完成从DNA序列中获取读码框、核酸序列向蛋白序列的转化、在蛋白序列数据库中查找同源序列、序列录入数据库以及蛋白序列的等电点、亲/疏水位点、二级结构等性质的分析、多个序列之间相似度和进化地位的分析,并对输出的结果数据利用Web服务器进行发布.与传统的序列分析模式相比,此分析系统大大加速了对大规模数据信息的分析和利用.
介紹利用常見的x86 PC,Linux操作繫統配閤BLAST、PHYLIB和EMBOSS等常見的生物分析軟件構建可以完成多種蛋白數據分析的大規模自動分析繫統.該繫統可自動完成從DNA序列中穫取讀碼框、覈痠序列嚮蛋白序列的轉化、在蛋白序列數據庫中查找同源序列、序列錄入數據庫以及蛋白序列的等電點、親/疏水位點、二級結構等性質的分析、多箇序列之間相似度和進化地位的分析,併對輸齣的結果數據利用Web服務器進行髮佈.與傳統的序列分析模式相比,此分析繫統大大加速瞭對大規模數據信息的分析和利用.
개소이용상견적x86 PC,Linux조작계통배합BLAST、PHYLIB화EMBOSS등상견적생물분석연건구건가이완성다충단백수거분석적대규모자동분석계통.해계통가자동완성종DNA서렬중획취독마광、핵산서렬향단백서렬적전화、재단백서렬수거고중사조동원서렬、서렬록입수거고이급단백서렬적등전점、친/소수위점、이급결구등성질적분석、다개서렬지간상사도화진화지위적분석,병대수출적결과수거이용Web복무기진행발포.여전통적서렬분석모식상비,차분석계통대대가속료대대규모수거신식적분석화이용.
