中国病理生理杂志
中國病理生理雜誌
중국병리생리잡지
CHINESE JOURNAL OF PATHOPHYSIOLOGY
2011年
5期
928-933
,共6页
刘毅%李秀英%莫雪梅%张光%孙晗笑
劉毅%李秀英%莫雪梅%張光%孫晗笑
류의%리수영%막설매%장광%손함소
心脏病,先天性%蛋白质相互作用网络%疾病易感基因%功能富集分析
心髒病,先天性%蛋白質相互作用網絡%疾病易感基因%功能富集分析
심장병,선천성%단백질상호작용망락%질병역감기인%공능부집분석
目的:应用生物信息学预测先天性心脏病相关易感基因,为先天性心脏病的临床诊断和治疗提供理论依据.方法:通过OMIM数据库获取已知的先天性心脏病相关易感基因.将已知的疾病相关易感基因作为"种子基因",利用蛋白质相互作用网络寻找邻近节点中富集了疾病相关易感基因的"种子基因",并视其邻居基因为候选的疾病相关易感基因.对已知的疾病相关易感基因进行GO、Pathway和Human Phenotype富集分析,并据此注释候选基因;运用文献挖掘法对候选基因进行验证性分析.结果:通过OMIM共获取已知的先天性心脏病相关易感基因28个,发现邻近节点中富集了疾病相关易感基因的"种子基因"4个,得到候选的疾病相关易感基因20个,通过功能富集分析从中预测出新的先天性心脏病易感基因7个.文献挖掘发现这7个基因在心脏发育过程中均起着极其重要的作用.结论:通过生物信息学分析发现7个候选基因与已知的先天性心脏病相关易感基因关系密切,提示该病的发生是多种基因相互作用的结果,为后续深化该病机制研究提供了有效的指导.
目的:應用生物信息學預測先天性心髒病相關易感基因,為先天性心髒病的臨床診斷和治療提供理論依據.方法:通過OMIM數據庫穫取已知的先天性心髒病相關易感基因.將已知的疾病相關易感基因作為"種子基因",利用蛋白質相互作用網絡尋找鄰近節點中富集瞭疾病相關易感基因的"種子基因",併視其鄰居基因為候選的疾病相關易感基因.對已知的疾病相關易感基因進行GO、Pathway和Human Phenotype富集分析,併據此註釋候選基因;運用文獻挖掘法對候選基因進行驗證性分析.結果:通過OMIM共穫取已知的先天性心髒病相關易感基因28箇,髮現鄰近節點中富集瞭疾病相關易感基因的"種子基因"4箇,得到候選的疾病相關易感基因20箇,通過功能富集分析從中預測齣新的先天性心髒病易感基因7箇.文獻挖掘髮現這7箇基因在心髒髮育過程中均起著極其重要的作用.結論:通過生物信息學分析髮現7箇候選基因與已知的先天性心髒病相關易感基因關繫密切,提示該病的髮生是多種基因相互作用的結果,為後續深化該病機製研究提供瞭有效的指導.
목적:응용생물신식학예측선천성심장병상관역감기인,위선천성심장병적림상진단화치료제공이론의거.방법:통과OMIM수거고획취이지적선천성심장병상관역감기인.장이지적질병상관역감기인작위"충자기인",이용단백질상호작용망락심조린근절점중부집료질병상관역감기인적"충자기인",병시기린거기인위후선적질병상관역감기인.대이지적질병상관역감기인진행GO、Pathway화Human Phenotype부집분석,병거차주석후선기인;운용문헌알굴법대후선기인진행험증성분석.결과:통과OMIM공획취이지적선천성심장병상관역감기인28개,발현린근절점중부집료질병상관역감기인적"충자기인"4개,득도후선적질병상관역감기인20개,통과공능부집분석종중예측출신적선천성심장병역감기인7개.문헌알굴발현저7개기인재심장발육과정중균기착겁기중요적작용.결론:통과생물신식학분석발현7개후선기인여이지적선천성심장병상관역감기인관계밀절,제시해병적발생시다충기인상호작용적결과,위후속심화해병궤제연구제공료유효적지도.
