CAJ | 학술논문

通过分析5种家蚕病毒基因组密码子和密码对使用模式,初步探讨5种家蚕病毒的基因组进化和对宿主的适应策略.采用生物信息学方法对碱基含量( GCall、GC1、GC2、GC3、GC3s)、有效密码子数(ENc)、相对同义密码子使用度(RSCU)、密码对(codon-pair)等进行统计分析的结果表明:5种家蚕病毒的密码子偏好性均较低,病毒间的碱基组成及ENc值差异较小,碱基组成对密码子使用模式影响较小；不同病毒选择不同的偏好性密码子,不同病毒的密码对偏好性程度不同,其中,家蚕类葡萄斑点病毒(Bombyx mori macula-like virus,BmMLV)密码对偏好性最强,家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cypovirus,BmCPV)和家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)密码对偏好性最弱.聚类分析表明BmCPV和家蚕浓核病毒(Bombyx mori densovirus,BmDNV)的密码子使用模式相似,BmNPV和家蚕传染性软化病病毒(Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV)的密码子使用模式相似；BmMLV、BmNPV和BmDNV的密码对使用模式相似,BmIFV和BmCPV的密码对使用模式相似.5种病毒的偏好性密码子和偏好性密码对不同,显示不同病毒的密码子和密码对的进化路径不同,对宿主的适应策略不同.
통과분석5충가잠병독기인조밀마자화밀마대사용모식,초보탐토5충가잠병독적기인조진화화대숙주적괄응책략.채용생물신식학방법대감기함량( GCall、GC1、GC2、GC3、GC3s)、유효밀마자수(ENc)、상대동의밀마자사용도(RSCU)、밀마대(codon-pair)등진행통계분석적결과표명:5충가잠병독적밀마자편호성균교저,병독간적감기조성급ENc치차이교소,감기조성대밀마자사용모식영향교소；불동병독선택불동적편호성밀마자,불동병독적밀마대편호성정도불동,기중,가잠류포도반점병독(Bombyx mori macula-like virus,BmMLV)밀마대편호성최강,가잠질형다각체병독(Bombyx mori cypovirus,BmCPV)화가잠핵형다각체병독(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)밀마대편호성최약.취류분석표명BmCPV화가잠농핵병독(Bombyx mori densovirus,BmDNV)적밀마자사용모식상사,BmNPV화가잠전염성연화병병독(Bombyx mori infectious flacherie virus,BmIFV)적밀마자사용모식상사；BmMLV、BmNPV화BmDNV적밀마대사용모식상사,BmIFV화BmCPV적밀마대사용모식상사.5충병독적편호성밀마자화편호성밀마대불동,현시불동병독적밀마자화밀마대적진화로경불동,대숙주적괄응책략불동.