生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
2期
139-141
,共3页
周贵良%洪来法%梁敏玲%郑柳城%陈转贤
週貴良%洪來法%樑敏玲%鄭柳城%陳轉賢
주귀량%홍래법%량민령%정류성%진전현
RefSeq转录本数据库%实时定量PCR
RefSeq轉錄本數據庫%實時定量PCR
RefSeq전록본수거고%실시정량PCR
利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Green I Real Time PCR引物,同时选取5 000条基因进行SYBR Green I Real Time PCR引物验证,95.92%的基因引物取得良好效果,1.64%的基因引物产生引物二聚体,1.08%的基因引物有非特异性扩增,通过生物信息技术分析与实验验证,建立了基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库.
利用NCBI提供的RefSeq序列,通過BLAT、Sim4和自主開髮的剪接比對程序Ealter1.0對人類RefSeq轉錄本進行外顯子預測,根據預測的外顯子信息,採用自主開髮SYBR Green I Real Time PCR引物設計程序E-qPCR-Design1.0高通量設計21,118對SYBR Green I Real Time PCR引物,同時選取5 000條基因進行SYBR Green I Real Time PCR引物驗證,95.92%的基因引物取得良好效果,1.64%的基因引物產生引物二聚體,1.08%的基因引物有非特異性擴增,通過生物信息技術分析與實驗驗證,建立瞭基于RefSeq的人類基因熒光定量PCR引物庫.
이용NCBI제공적RefSeq서렬,통과BLAT、Sim4화자주개발적전접비대정서Ealter1.0대인류RefSeq전록본진행외현자예측,근거예측적외현자신식,채용자주개발SYBR Green I Real Time PCR인물설계정서E-qPCR-Design1.0고통량설계21,118대SYBR Green I Real Time PCR인물,동시선취5 000조기인진행SYBR Green I Real Time PCR인물험증,95.92%적기인인물취득량호효과,1.64%적기인인물산생인물이취체,1.08%적기인인물유비특이성확증,통과생물신식기술분석여실험험증,건립료기우RefSeq적인류기인형광정량PCR인물고.
