西安交通大学学报(医学版)
西安交通大學學報(醫學版)
서안교통대학학보(의학판)
JOURNAL OF XI'AN JIAOTONG UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2011年
2期
170-174
,共5页
孙俊毅%孙媛媛%苟建重%李昂
孫俊毅%孫媛媛%茍建重%李昂
손준의%손원원%구건중%리앙
牙龈卟啉单胞菌%外膜蛋白%鸟枪法%蛋白质组学
牙齦卟啉單胞菌%外膜蛋白%鳥鎗法%蛋白質組學
아간계람단포균%외막단백%조창법%단백질조학
目的 利用shotgun(鸟枪)蛋白质组学策略鉴定牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis, P.g)亚型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白质组学研究,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定基础.方法 提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE电泳分离蛋白,胶内酶解为多肽混合物,应用毛细管高效液相色谱加串联质谱分析,SEQUEST程序进行数据库搜索并鉴定蛋白.结果 用考马斯亮蓝法染色凝胶分离的蛋白,发现P.g47A-1蛋白条带主要在14.3~97ku之间.酶解的肽段经毛细管高效液相色谱分离,得到肽段水平的总离子流图,分析肽段序列后发现P.g47A-1蛋白有623个唯一肽段,鉴定出136种蛋白,包括了51种已知蛋白,85种未知蛋白.结论 Shotgun技术可分析出P.g47A-1大量未知蛋白,尤其是丰度低、疏水性强的外膜蛋白,优于二维凝胶电泳(two dimensional gel electrophoresis, 2-DE)等传统蛋白质组学方法,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定了基础.
目的 利用shotgun(鳥鎗)蛋白質組學策略鑒定牙齦卟啉單胞菌(Porphyromonas gingivalis, P.g)亞型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白質組學研究,為進一步研究P.g外膜蛋白的緻病性奠定基礎.方法 提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE電泳分離蛋白,膠內酶解為多肽混閤物,應用毛細管高效液相色譜加串聯質譜分析,SEQUEST程序進行數據庫搜索併鑒定蛋白.結果 用攷馬斯亮藍法染色凝膠分離的蛋白,髮現P.g47A-1蛋白條帶主要在14.3~97ku之間.酶解的肽段經毛細管高效液相色譜分離,得到肽段水平的總離子流圖,分析肽段序列後髮現P.g47A-1蛋白有623箇唯一肽段,鑒定齣136種蛋白,包括瞭51種已知蛋白,85種未知蛋白.結論 Shotgun技術可分析齣P.g47A-1大量未知蛋白,尤其是豐度低、疏水性彊的外膜蛋白,優于二維凝膠電泳(two dimensional gel electrophoresis, 2-DE)等傳統蛋白質組學方法,為進一步研究P.g外膜蛋白的緻病性奠定瞭基礎.
목적 이용shotgun(조창)단백질조학책략감정아간계람단포균(Porphyromonas gingivalis, P.g)아형47A-1외막단백,심화P.g외막단백적단백질조학연구,위진일보연구P.g외막단백적치병성전정기출.방법 제취P.g47A-1외막단백,SDS-PAGE전영분리단백,효내매해위다태혼합물,응용모세관고효액상색보가천련질보분석,SEQUEST정서진행수거고수색병감정단백.결과 용고마사량람법염색응효분리적단백,발현P.g47A-1단백조대주요재14.3~97ku지간.매해적태단경모세관고효액상색보분리,득도태단수평적총리자류도,분석태단서렬후발현P.g47A-1단백유623개유일태단,감정출136충단백,포괄료51충이지단백,85충미지단백.결론 Shotgun기술가분석출P.g47A-1대량미지단백,우기시봉도저、소수성강적외막단백,우우이유응효전영(two dimensional gel electrophoresis, 2-DE)등전통단백질조학방법,위진일보연구P.g외막단백적치병성전정료기출.